囊性与实性前庭神经鞘瘤患者转录组范围分析揭示候选长链非编码RNA分子特征

该数据集来自NCBI GEO,包含囊性与实性前庭神经鞘瘤患者的转录组范围表达谱数据,基于高通量测序平台GPL24676(人9606),共1个文件

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基因组分类GPL246769606
GSE278713: Transcriptome-wide Profiling between Cystic and Solid Vestibular Schwannoma Patients Reveal Candidate Long noncoding RNA molecular signatures

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-18

资源简介

囊性与实性前庭神经鞘瘤患者转录组范围分析揭示候选长链非编码RNA分子特征

Transcriptome-wide Profiling between Cystic and Solid Vestibular Schwannoma Patients Reveal Candidate Long noncoding RNA molecular signatures

该数据集来自NCBI GEO,包含囊性与实性前庭神经鞘瘤患者的转录组范围表达谱数据,基于高通量测序平台GPL24676(人9606),共1个文件。研究旨在识别与囊性前庭神经鞘瘤相关的长链非编码RNA分子特征,可用于比较两种亚型的转录组差异、筛选候选lncRNA标志物,并为后续肿瘤分子机制研究提供数据基础(来源 NCBI)。

【数据集背景】

源站首次发布:Oct 03 202。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):前庭神经鞘瘤(VS)是一种起源于第八前庭蜗神经施万细胞的良性肿瘤。它们占脑肿瘤的6-8%,其中80%的肿瘤起源于小脑脑桥角。囊性前庭神经鞘瘤(cVS)占前庭神经鞘瘤的10%,与实性前庭神经鞘瘤(sVS)相比,其生长行为不可预测且手术预后较差。长链非编码RNA(lncRNA)属于非编码RNA类别,已知可通过多种机制调控基因转录并参与染色质重塑。尽管越来越多的证据表明lncRNA在多种癌症中发挥关键作用,但其在cVS疾病中的全面鉴定仍未知。本研究的目标是利用患者队列识别与cVS相关的lncRNA。应用下一代测序

【数据结构与技术规格】

文件数 1 个,合计 0 B。

【主题与分类】

主题标签:GPL24676、9606。本站分类:肿瘤/脑肿瘤。

【获取与许可】

源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE278713

【使用注意】

· 源站最后修改于 Jul 31 202,引用时请注意版本时效。

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    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

前庭神经鞘瘤(VS)是一种起源于第八前庭蜗神经施万细胞的良性肿瘤。其占脑肿瘤的6-8%,其中80%的肿瘤起源于小脑脑桥角。囊性前庭神经鞘瘤(cVS)占前庭神经鞘瘤的10%,与实性前庭神经鞘瘤(sVS)相比,其生长行为难以预测且手术预后较差。长链非编码RNA(lncRNA)属于非编码RNA类别,已知可通过多种机制调控基因转录并参与染色质重塑。尽管越来越多的证据表明lncRNA在多种癌症中发挥关键作用,但其在cVS疾病中的全面鉴定仍属未知。本研究旨在利用患者队列鉴定与cVS相关的lncRNA。我们应用下一代测序技术进行了全转录组测序(RNA-seq)分析,并鉴定了在cVS与sVS之间差异表达的lncRNA。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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