缺氧诱导可变剪接转录本DGKG Δ exon13促进胶质母细胞瘤进展
该数据集来自NCBI GEO,包含胶质母细胞瘤(GBM)在缺氧条件下通过可变剪接产生的新转录本DGKG Δ exon13相关的高通量测序表达谱数据

基本信息
资源简介
缺氧诱导可变剪接转录本DGKG Δ exon13促进胶质母细胞瘤进展
Hypoxia induced alternative splicing transcript DGKG Δ exon13 promotes glioblastoma progression
该数据集来自NCBI GEO,包含胶质母细胞瘤(GBM)在缺氧条件下通过可变剪接产生的新转录本DGKG Δ exon13相关的高通量测序表达谱数据。数据涉及U87-MG和T98G细胞系,可用于研究缺氧微环境促进GBM进展的分子机制,以及DGKG Δ exon13对细胞增殖、迁移和侵袭能力的影响(来源 NCBI)。
【数据集背景】
源站首次发布:Aug 26 202。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):胶质母细胞瘤(GBM)是中枢神经系统肿瘤中最恶性的类型之一。肿瘤微环境中的缺氧被认为是促进GBM进展的重要因素。我们发现,在缺氧条件下,GBM通过可变剪接产生了新的转录本DGKG Δ exon13。此外,CCK8、Transwell和Matrigel-transwell实验结果表明,DGKG敲低后U87-MG和T98G的增殖、迁移和侵袭能力下降。与野生型DGKG相比,过表达DGKG Δexon13显著促进了GBM细胞的增殖、迁移和侵袭能力。
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个,合计 0 B。
【主题与分类】
主题标签:GPL24676、9606。本站分类:肿瘤/脑肿瘤。
【获取与许可】
源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE275660
【使用注意】
· 源站最后修改于 Aug 20 202,引用时请注意版本时效。
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- OpenDataLab:
数据说明
胶质母细胞瘤(GBM)是中枢神经系统肿瘤中恶性程度最高的类型之一。肿瘤微环境中的缺氧被认为是促进GBM进展的重要因素。我们发现,在缺氧条件下,GBM通过可变剪接产生了新的转录本DGKG Δ外显子13。此外,CCK8、Transwell和Matrigel-transwell实验结果表明,敲低DGKG后,U87-MG和T98G的增殖、迁移和侵袭能力均下降。与野生型DGKG相比,过表达DGKG Δ外显子13显著促进了GBM细胞的增殖、迁移和侵袭能力。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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