脑胶质母细胞瘤样本空间转录组RNA测序数据集

该数据集为脑胶质母细胞瘤样本的空间转录组RNA测序(stRNA-seq)数据,来源于NCBI GEO(GSE273275),包含1个文件

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基因组分类OtherGPL203019606
GSE273275: stRNA-seq of brain glioblastoma sample

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-21

资源简介

脑胶质母细胞瘤样本空间转录组RNA测序数据集

stRNA-seq of brain glioblastoma sample

该数据集为脑胶质母细胞瘤样本的空间转录组RNA测序(stRNA-seq)数据,来源于NCBI GEO(GSE273275),包含1个文件。源站描述显示研究结合scRNA-seq(3V3)与stRNA-seq(1V1)对肿瘤核心及匹配的肿瘤周边样本进行测序,以刻画胶质瘤中肿瘤与非肿瘤细胞的整体图谱,并关注巨噬细胞调控 proneural-mesenchymal transition(PMT)的机制。数据可用于脑肿瘤微环境、细胞异质性及PMT相关研究(来源 NCBI)。

【数据集背景】

源站首次发布:Jul 28 202。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):Proneural-mesenchymal transition (PMT) 是一种表型改变,促进胶质母细胞瘤(GBM)的治疗抵抗和复发。巨噬细胞作为肿瘤免疫微环境(TIM)的主要浸润成分,可以调控PMT的生物学过程。然而,驱动这一过程的机制在很大程度上仍不清楚。在这里,我们对肿瘤核心及匹配的肿瘤周边样本进行了单细胞RNA测序(scRNA-seq)(3V3)和空间转录组RNA测序(stRNA-seq)(1V1),以描述胶质瘤中肿瘤和非肿瘤细胞的整体图谱。

【数据结构与技术规格】

文件数 1 个,合计 0 B。

【主题与分类】

主题标签:Other、GPL20301、9606。本站分类:肿瘤/脑肿瘤。

【获取与许可】

源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE273275

【使用注意】

· 源站最后修改于 Feb 15 202,引用时请注意版本时效。

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    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

前神经-间质转化(PMT)是一种表型改变,可导致胶质母细胞瘤(GBM)的治疗耐药和复发。巨噬细胞作为肿瘤免疫微环境(TIM)的主要浸润成分,能够调控PMT的生物学过程。然而,驱动这一过程的机制在很大程度上仍不清楚。在本研究中,我们对肿瘤核心及配对的肿瘤周边样本进行了单细胞RNA测序(scRNA-seq)(3V3)和空间转录组RNA测序(stRNA-seq)(1V1),以描绘胶质瘤中肿瘤细胞与非肿瘤细胞的整体图谱。

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