胶质母细胞瘤中周细胞调控肿瘤抑制性微环境的空间转录组数据
该数据集来自 NCBI GEO(GSE272236),聚焦胶质母细胞瘤中周细胞对肿瘤微环境的调控作用。研究通过原位与转基因高级别胶质瘤小鼠模型,结合单细胞与空间转录组技术,评估周细胞耗竭对胶质瘤发生和进展的影响
![GSE272236: Pericytes orchestrate a tumor-restraining microenvironment in glioblastoma [Spatial Transcriptomics]](/medical-api/medicalDataset/datasetCover/156452.jpg)
基本信息
资源简介
胶质母细胞瘤中周细胞调控肿瘤抑制性微环境的空间转录组数据
Pericytes orchestrate a tumor-restraining microenvironment in glioblastoma [Spatial Transcriptomics]
该数据集来自 NCBI GEO(GSE272236),聚焦胶质母细胞瘤中周细胞对肿瘤微环境的调控作用。研究通过原位与转基因高级别胶质瘤小鼠模型,结合单细胞与空间转录组技术,评估周细胞耗竭对胶质瘤发生和进展的影响。数据包含 1 个文件(GSE272236_series_matrix.txt.gz),可用于探索周细胞维持肿瘤抑制性微环境的机制,并为 GBM 治疗中保护周细胞的策略提供数据支持(来源 NCBI)。
【数据集背景】
源站首次发布:Jul 15 202。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):为了在功能上评估周细胞在胶质瘤发生和进展中的作用,我们利用单细胞和空间转录组技术,研究周细胞耗竭在高级别胶质瘤原位和转基因小鼠模型中的效应。我们提供证据表明,周细胞通过协调肿瘤抑制性微环境来减缓胶质瘤的发生,挑战了周细胞仅作为促癌细胞的观念,并强调了在未来 GBM 治疗中保护周细胞的重要性。
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个,合计 0 B。
【主题与分类】
主题标签:Other、GPL24247、10090。本站分类:肿瘤/脑肿瘤。
【获取与许可】
源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE272236
【使用注意】
· 源站最后修改于 Jan 07 202,引用时请注意版本时效。
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pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
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- OpenDataLab:
数据说明
为了从功能上评估周细胞在胶质瘤发生和进展中的作用,我们利用单细胞和空间转录组学,研究了在高分级胶质瘤的原位和转基因小鼠模型中耗竭周细胞的影响。我们提供的证据表明,周细胞通过协调一个肿瘤抑制性微环境来减缓胶质瘤的发展,这挑战了将周细胞仅视为促癌细胞的观点,并强调了在未来GBM治疗中保护周细胞的重要性。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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