IDH突变型胶质瘤单细胞测序数据集

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE270109

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

胶质瘤是一种常见且致命的脑肿瘤，以显著的细胞异质性和代谢改变为特征，然而高级别（多形性胶质母细胞瘤，WHO IV级）和低级别（少突星形细胞瘤，WHO II级）胶质瘤的完整细胞起源及代谢图谱仍不明确。在本研究中，我们对这些级别的胶质瘤进行了单细胞转录组测序，以阐明其细胞和代谢差异。在鉴定细胞类型后，我们比较了高级别与低级别胶质瘤之间的代谢通路活性和基因表达。综合分析确定了所有细胞类型中变化最大的代谢通路（MCPs）和基因，并进一步利用TCGA和CGGA数据集验证了其临床意义。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。