GSE268111：EC-8042破坏初级SP/KLF转录调控网络及HDACi治疗诱导的次级网络。[H3K27me3 ChIP-seq]

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE268111

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

弥漫性内生性脑桥胶质瘤（DIPGs）是致死性的儿童脑肿瘤，治疗选择有限。这类肿瘤常携带H3K27M突变，在临床试验中对组蛋白去乙酰化酶抑制剂（HDACi）耐药，其原因尚不清楚。鉴于此，亟需探究HDACi临床表现不足的原因，并确定治疗DIPG的有效联合治疗策略。为探索将HDACi与EC-8042（一种米特拉霉素类似物，可阻断SP/KLF因子的DNA结合）联合使用的可能性，我们对经DMSO、EC-8042、伏立诺他及伏立诺他联合EC-8042处理后的SU-DIPG-XVII细胞进行了H3K27me3的ChIP-seq分析，发现EC-8042可逆转由HDACi引起的激活转录程序。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。