靶向胶质母细胞瘤的脑渗透性药物通过NLE1-Notch1复合体损伤脑肿瘤干细胞

该数据集来自NCBI GEO,包含一项针对胶质母细胞瘤的研究,探索脑渗透性药物Edaravone对脑肿瘤干细胞(BTSCs)的作用

geo
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基因组分类GPL185739606
GSE261132: Targeting glioblastoma with a brain penetrant drug that impairs brain tumour stem cells via NLE1-Notch1 complex

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-21

资源简介

靶向胶质母细胞瘤的脑渗透性药物通过NLE1-Notch1复合体损伤脑肿瘤干细胞

Targeting glioblastoma with a brain penetrant drug that impairs brain tumour stem cells via NLE1-Notch1 complex

该数据集来自NCBI GEO,包含一项针对胶质母细胞瘤的研究,探索脑渗透性药物Edaravone对脑肿瘤干细胞(BTSCs)的作用。数据通过高通量测序进行全局基因表达谱分析,揭示Edaravone显著改变BTSC转录组,并减弱细胞周期、干性和DNA修复相关基因的表达。数据集可用于研究药物对BTSC的转录影响及Notchless相关机制(来源 NCBI)。

【数据集背景】

源站首次发布:Mar 07 202。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):脑肿瘤干细胞(BTSCs)是一群自我更新的恶性干细胞,在胶质母细胞瘤的肿瘤层级中发挥重要作用,并促进肿瘤生长、治疗抵抗和肿瘤复发。因此,在肿瘤主体内靶向BTSCs是一项关键的治疗策略。在此,我们报道Edaravone是一种有效的药物,可损伤BTSCs并阻碍胶质母细胞瘤的肿瘤发生。我们显示Edaravone抑制携带多种致癌突变的BTSCs的自我更新和生长,而不影响非致癌性神经干细胞。全局基因表达谱分析揭示Edaravone显著改变BTSC转录组,并减弱大量参与细胞周期进程、干性和DNA修复机制的基因的表达。在机制上,我们发现Edaravone直接靶向Notchless homo

【数据结构与技术规格】

文件数 1 个,合计 0 B。

【主题与分类】

主题标签:GPL18573、9606。本站分类:肿瘤/脑肿瘤。

【获取与许可】

源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE261132

【使用注意】

· 源站最后修改于 Nov 20 202,引用时请注意版本时效。

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    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

脑肿瘤干细胞(BTSCs)是一群具有自我更新能力的恶性干细胞,在胶质母细胞瘤的肿瘤层级结构中发挥重要作用,并促进肿瘤生长、治疗耐药及肿瘤复发。因此,靶向肿瘤主体内的BTSCs是一项关键的治疗策略。在此,我们报道依达拉奉(Edaravone)是一种有效药物,可损伤BTSCs并抑制胶质母细胞瘤的肿瘤发生。我们证明,依达拉奉可抑制携带多种致癌突变的BTSCs的自我更新和生长,而不影响非致癌性神经干细胞。全局基因表达谱分析显示,依达拉奉显著改变BTSC转录组,并减弱大量参与细胞周期进程、干性维持及DNA修复机制的基因表达。在机制上,我们发现依达拉奉直接靶向Notchless homolog 1(NLE1),损伤Notch信号通路,改变干细胞标志物的表达,并使BTSC对电离辐射(IR)诱导的细胞死亡更为敏感。

重要的是,我们证明在临床前模型中,依达拉奉治疗可延迟胶质母细胞瘤的发生,增强其对IR的敏感性,并延长动物的寿命。我们的数据表明,重新利用依达拉奉是胶质母细胞瘤患者一种有前景的治疗策略。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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