GSE261042：自噬抑制使高级别突变IDH1胶质瘤对放疗敏感

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE261042

标准获取流程：

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   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

突变型异柠檬酸脱氢酶1（mIDH1）催化2-羟基戊二酸（2-HG）的生成，导致TP53/ATRX缺失的星形细胞瘤发生表观遗传重编程。RNA测序、单细胞RNA测序和染色质免疫沉淀测序及后续分析显示，人和小鼠mIDH1胶质瘤中线粒体代谢相关的基因本体（GOs）下调，而自噬相关的GOs上调。线粒体代谢降低伴随糖酵解减少，使自噬成为mIDH1胶质瘤的能量来源。突变型IDH1胶质瘤细胞自噬相关蛋白表达增加，LC3 I/II转化增强，表明自噬增强。通过给予包裹自噬相关基因7沉默RNA的合成蛋白纳米颗粒在体内抑制自噬，使mIDH1胶质瘤细胞对放疗敏感，导致肿瘤消退、长期生存和免疫记忆。这项工作揭示了自噬是mIDH1胶质瘤生存的关键途径，抑制自噬可在体外使人和小鼠mIDH1胶质瘤细胞对放疗敏感，并在体内mIDH1模型中产生放疗增敏效应。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。