突变IDH抑制剂诱导IDH突变少突胶质瘤谱系分化I

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE260928

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   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
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数据说明

一部分IDH突变型胶质瘤患者对突变IDH抑制剂（IDHi）有应答，但这种应答的分子基础尚不清楚。在此，我们对来自临床获益于IDHi的三例IDH突变型少突胶质细胞瘤患者的样本进行了单细胞或单细胞核RNA测序分析。重要的是，这些组织是在用药期间、治疗开始后四周取样的。我们进一步将我们的发现与来自独立队列和实验模型的单细胞及批量转录组分析进行了整合。我们发现，IDHi治疗诱导了向星形胶质细胞谱系的强烈分化，伴随干细胞样细胞的耗竭和细胞增殖的减少。此外，NOTCH1突变与星形胶质细胞分化减少相关，并可能限制对IDHi的应答。我们的研究凸显了IDHi对驱动少突胶质细胞瘤的细胞层级的分化潜能，并提示了一种可能改善患者分层的遗传修饰因素。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。