患者配对原发与复发胶质母细胞瘤多维分析:小胶质细胞FCGR1A(CD64)及其他FCGRs参与肿瘤复发

该数据集为NCBI GEO上的SuperSeries,聚焦患者配对的初发与复发胶质母细胞瘤,通过高通量测序进行表达谱分析,旨在识别小胶质细胞FCGR1A(CD64)及其他FCGR家族成员在肿瘤复发中的作用

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基因组分类GPL246769606
GSE254875: Multidimensional analysis of patient-matched primary and recurrent glioblastoma identifies microglial FCGR1A (CD64) and other FCGRs as contributors of tumor recurrence

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-21

资源简介

患者配对原发与复发胶质母细胞瘤多维分析:小胶质细胞FCGR1A(CD64)及其他FCGRs参与肿瘤复发

GSE254875 是 NCBI GEO 上的一个 SuperSeries,聚焦患者配对的初发与复发胶质母细胞瘤,通过高通量测序开展表达谱分析,旨在识别小胶质细胞 FCGR1A(CD64)及其他 FCGR 家族成员在肿瘤复发中的作用。该数据集属于肿瘤 / 脑肿瘤分类,由 Sabrina、Annie、Hogan 提交,发布时间为 Feb 01 202,包含 1 个数据文件,样例文件为 GSE254875_series_matrix.txt.gz。整体而言,该数据集围绕胶质母细胞瘤复发机制这一主题,提供基于测序的表达谱数据资源,适合关注脑肿瘤复发、小胶质细胞功能及 FCGR 家族分子特征的研究者参考使用。

【数据集背景】

胶质母细胞瘤是脑肿瘤中复发问题突出的类型,理解初发与复发肿瘤之间的分子差异对揭示复发机制具有重要意义。该数据集以患者配对的初发与复发胶质母细胞瘤为研究对象,通过多维分析寻找与肿瘤复发相关的分子特征,并将小胶质细胞的 FCGR1A(CD64)及其他 FCGR 家族成员作为复发贡献因素的研究重点。源站标题与数据集英文名均体现了这一研究定位,主题标签中的 Expression profiling by high throughput sequencing 表明其采用高通量测序进行表达谱分析,9606 对应人类物种信息。

【数据内容】

该数据集为 SuperSeries,源站描述说明其由下方列出的 SubSeries 组成。数据集包含 1 个文件,样例文件名为 GSE254875_series_matrix.txt.gz,属于表达谱系列矩阵文件。主题标签中包含 GPL24676 平台信息。数据内容围绕患者配对的初发与复发胶质母细胞瘤样本的表达谱展开,用于支撑小胶质细胞 FCGR1A(CD64)及其他 FCGR 家族成员与肿瘤复发关系的研究。除上述信息外,样本数量、分组细节、具体基因层面的结果等内容源站未提供。

【采集与来源】

该数据集来源于 ncbi.nlm.nih.gov,属于 NCBI GEO 数据库中的 SuperSeries 条目。提交者信息为 Sabrina、Annie、Hogan,发布时间为 Feb 01 202。数据通过高通量测序方式产生表达谱信息,主题标签中的 GPL24676 指向所使用的测序平台。关于样本采集地点、伦理审批、患者临床信息等具体采集细节,源站未提供。

【适用场景】

该数据集适用于胶质母细胞瘤复发机制相关的研究场景,尤其是关注初发与复发配对样本之间表达差异的分析工作。由于研究主题涉及小胶质细胞 FCGR1A(CD64)及其他 FCGR 家族成员,也可用于围绕 FCGR 家族在肿瘤复发中作用的探索性分析。此外,该数据可作为脑肿瘤表达谱研究的参考数据,用于方法验证、候选分子筛选或与其他胶质母细胞瘤数据集的比较研究。具体适用性需结合使用者自身研究问题判断。

【使用方法】

使用时可先下载数据文件 GSE254875_series_matrix.txt.gz,该文件为 GZIP 压缩包格式。读取时应按文件格式进行解压与解析,建议先在小样本上核对字段与编码,确认无误后再批量接入分析流程。由于该数据集为 SuperSeries,实际分析时还需结合其下属 SubSeries 的组织方式理解数据结构。关于具体的分析流程、标准化方法及推荐工具,源站未提供。

【质量与限制】

该数据集为 NCBI GEO 收录的 SuperSeries,来源站明确、提交者与发布时间可查,具备基本的可追溯性。但数据集仅包含 1 个文件,且源站描述较为简略,仅说明由 SubSeries 组成,未提供样本量、测序深度、数据质控指标等细节。因此,使用者在分析前应自行评估数据完整性与适用性。关于数据质量评价、批次效应、缺失值情况等,源站未提供。

【引用与许可】

该数据集标题为 Multidimensional analysis of patient-matched primary and recurrent glioblastoma identifies microglial FCGR1A (CD64) and other FCGRs as contributors of tumor recurrence,提交者为 Sabrina、Annie、Hogan,来源为 ncbi.nlm.nih.gov。使用时应遵循 NCBI GEO 的相关使用条款并引用该数据集。关于具体的许可协议、使用限制及配套文献信息,源站未提供。

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使用方式

数据集获取

源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE254875

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

This SuperSeries is composed of the SubSeries listed below.

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