GSE252709:胶质母细胞瘤中disulfidptosis亚型的整合多组学分析
样本为2022年1月至2023年12月在天坛医院接受手术的胶质母细胞瘤患者的转录组测序数据。数据可用于研究disulfidptosis在胶质母细胞瘤中的作用,并支持基于表达谱的肿瘤亚型分类分析(来源 NCBI)

基本信息
资源简介
GSE252709:胶质母细胞瘤中disulfidptosis亚型的整合多组学分析
Integrated Multiomic Analysis Reveals disulfidptosis Subtypes in Glioblastoma
该数据集来自NCBI GEO,标题为胶质母细胞瘤中disulfidptosis亚型的整合多组学分析,包含1个文件GSE252709_series_matrix.txt.gz。样本为2022年1月至2023年12月在天坛医院接受手术的胶质母细胞瘤患者的转录组测序数据。数据可用于研究disulfidptosis在胶质母细胞瘤中的作用,并支持基于表达谱的肿瘤亚型分类分析(来源 NCBI)。
【数据集背景】
源站首次发布:Jan 08 202。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):胶质母细胞瘤(GBM)是最具侵袭性和致命性的脑肿瘤,可行的治疗选择极为稀缺。认识到GBM患者预后存在显著异质性并对其进行亚型划分,对精准治疗至关重要。disulfidptosis是最近被识别的一种细胞死亡形式,与肿瘤葡萄糖代谢异常和二硫化物应激密切相关,主要发生在SLC7A11高表达的肿瘤中。既往研究表明,胶质瘤表现出SLC7A11高表达、高代谢和葡萄糖缺乏。因此,我们对disulfidptosis在胶质母细胞瘤中的作用进行了深入研究。收集了2022年1月至2023年12月在天坛医院接受手术治疗的胶质母细胞瘤患者的样本进行转录组测序。同时,患者数据
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个,合计 0 B。
【主题与分类】
主题标签:GPL24676、9606。本站分类:肿瘤/脑肿瘤。
【获取与许可】
源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE252709
【使用注意】
· 源站最后修改于 Jan 01 202,引用时请注意版本时效。
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- OpenDataLab:
数据说明
胶质母细胞瘤(GBM)是最具侵袭性和致命性的脑肿瘤,可行的治疗选择极为匮乏。认识到GBM患者预后存在显著异质性并对其进行亚型划分,对于精准治疗至关重要。二硫死亡(disulfidptosis)是近期被识别的一种细胞死亡形式,与肿瘤葡萄糖代谢异常及二硫化物应激密切相关,主要发生于SLC7A11高表达的肿瘤中。既往研究表明,胶质瘤表现出SLC7A11高表达、高代谢及葡萄糖缺乏的特征。因此,我们对二硫死亡在胶质母细胞瘤中的作用进行了深入研究。收集2022年1月至2023年12月在天坛医院接受手术治疗的胶质母细胞瘤患者样本进行转录组测序,同时收集CGGA和TCGA数据库中的患者数据。
基于二硫死亡特征,采用共识聚类将GBM患者分为两个亚型,其中二硫死亡相关基因组聚类(DRGcluster)A患者的总体生存期(OS)显著改善,而DRGcluster B患者则呈现相反趋势。此外,两个DRGcluster亚型在肿瘤免疫微环境中表现出不同模式,包括免疫细胞浸润或细胞因子表达的差异。对肿瘤分析中免疫功能障碍、免疫排斥及亚类映射的进一步审查显示,DRGcluster A患者对免疫治疗(尤其是抗PD1治疗)产生阳性应答的可能性更高。pRRophetic算法进一步揭示了不同DRGcluster之间在常用化疗和靶向治疗的IC50值上存在显著差异。最后,利用来自加权基因共表达网络分析(WGCNA)模型中与胶质母细胞瘤发生密切相关的基因集以及显著不同的
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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