13例手术切除样本中的脑恶性肿瘤脑血管系统

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE242044

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

人脑血管系统的功能障碍参与多种神经疾病的发病机制，而血脑屏障（BBB）作为脑血管系统的一种器官型特化结构，阻碍了系统性疗法对几乎所有脑部疾病的递送。在此，我们开发了一种新方法，能够以高捕获效率和高细胞活力从人脑血管系统中分离新鲜细胞，并对来自13例手术切除样本的人脑血管细胞进行了单细胞mRNA测序（scRNAseq），样本包括正常人脑组织和胶质瘤——最常见的脑部恶性肿瘤。我们分析了103,230个单细胞的转录组，包括57,324个内皮细胞和27,703个血管壁细胞。我们在分子水平上定义了BBB中的主要血管细胞类型，并揭示了内皮细胞、血管壁细胞和血管周围成纤维细胞沿动静脉轴异质性的分子基础。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。