GSE240516：CCDC50通过调控EGFR细胞表面循环促进胶质母细胞瘤进展

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE240516

标准获取流程：

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   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

胶质母细胞瘤（GBM）是一种高死亡率的恶性肿瘤。然而，肿瘤进展的机制仍知之甚少。具体而言，我们发现自噬溶酶体相关蛋白CCDC50的表达与肿瘤恶性程度及GBM患者的不良生存率呈正相关。CCDC50作为一种特定的货物衔接蛋白，协助EGFR回收至质膜，导致下游信号通路的持续激活。我们发现，靶向GBM中的CCDC50可能是一种有前景的治疗策略，因为CCDC50缺陷在体外和体内均显著抑制了肿瘤细胞的增殖和迁移。此外，靶向CCDC50联合烷化剂替莫唑胺（TMZ）在GBM肿瘤消退中诱导协同作用，代表了恶性肿瘤治疗的替代策略。我们在shCtrl和shCCDC50细胞中进行了转录组分析（RNA-seq）和定量逆转录聚合酶链反应（qRT–PCR），以评估CCDC50调控的GBM肿瘤生长和转移。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。