GSE234341：CRISPR激活筛选鉴定GNAO1为胶质母细胞瘤细胞分化驱动因子

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE234341

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

诱导肿瘤细胞分化是治疗包括胶质瘤在内的恶性肿瘤的一种潜在策略。本研究通过全基因组CRISPR激活筛选，鉴定出G蛋白亚基αO1（GNAO1）是胶质瘤细胞分化的关键调控因子。GNAO1过表达联合小分子抑制剂混合物（包括CHIR99021、SB431542、RepSox和Y27632）可显著促进胶质母细胞瘤细胞的神经元分化。GNAO1在正常神经组织中高表达，而在胶质瘤中低表达。GNAO1高表达与较好的预后相关。GNAO1过表达可降低细胞增殖、细胞迁移及原位GBM肿瘤异种移植物的生长。GNAO1过表达通过下调转录因子HES1（神经元分化的关键介导因子）激活神经元分化通路。GNAO1招募TRIM21，并增强TRIM21介导的CREB泛素化与降解，导致p300介导的HES1启动子H3K27ac水平降低及HES1下调。此外，GNAO1 mRNA的稳定性受METTL3调控的N6-甲基腺苷（m6A）修饰调节。

GNAO1的过表达增强了胶质母细胞瘤对替莫唑胺（TMZ）的响应，并延长了携带原位GBM异种移植肿瘤动物的生存期。我们的发现表明，通过工程化GNAO1过表达诱导胶质母细胞瘤细胞的神经元分化是一种潜在的治疗策略，该策略不仅减少了肿瘤细胞增殖，还增强了肿瘤细胞对化疗的响应。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。