ZIKV感染HTR8细胞与U251细胞的转录谱

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE234128

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

为识别参与寨卡病毒（ZIKV）感染的各种宿主因子，我们比较了寨卡病毒感染的早孕期人胎盘滋养层细胞（HTR8）和胶质母细胞瘤星形细胞瘤细胞（U251-MG）的转录谱。我们的结果表明，在这两种细胞类型感染寨卡病毒后，共同的干扰素、炎性细胞因子和趋化因子的产生被激活，而若干差异表达基因（DEGs）富集于与细胞类型特征相关的不同生物学过程。我们的发现鉴定了多个与寨卡病毒致病机制及先天性寨卡综合征（CZS）潜在治疗相关的宿主因子。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。