设计肽靶向EAG2-Kvβ2钾通道治疗胶质母细胞瘤数据集

该数据集包含来自异种移植GBM肿瘤(G411)NSG小鼠模型的原始单细胞RNAseq数据,模型分别接受对照肽K59-78TAT或设计肽K90-114TAT处理;同时包含来自GBM细胞(G411)-神经元共培养模型的原始bulk RNAseq数据,同样接受上述两种肽处理

geo
浏览 5
基因组分类GPL167919606
GSE231577: A designer peptide against the EAG2-Kvβ2 potassium channel targets the interaction of cancer cells and neurons to treat glioblastoma

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-07

资源简介

设计肽靶向EAG2-Kvβ2钾通道治疗胶质母细胞瘤数据集

A designer peptide against the EAG2-Kvβ2 potassium channel targets the interaction of cancer cells and neurons to treat glioblastoma

该数据集包含来自异种移植GBM肿瘤(G411)NSG小鼠模型的原始单细胞RNAseq数据,模型分别接受对照肽K59-78TAT或设计肽K90-114TAT处理;同时包含来自GBM细胞(G411)-神经元共培养模型的原始bulk RNAseq数据,同样接受上述两种肽处理。项目聚焦于设计肽引起的肿瘤细胞转录组改变。数据可用于研究设计肽对胶质母细胞瘤细胞与神经元相互作用的转录调控影响,支持差异表达分析和细胞类型特异性响应探索(来源 NCBI)。

【数据集背景】

源站首次发布:May 03 202。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):该数据集包括来自异种移植GBM肿瘤(G411)荷瘤NSG小鼠模型的原始单细胞RNAseq数据,该模型分别用对照肽K59-78TAT或设计肽K90-114TAT处理;还包括来自GBM细胞(G411)-神经元共培养模型的原始bulk RNAseq数据,该模型分别用对照肽K59-78TAT或设计肽K90-114TAT处理。在本项目中,我们重点关注设计肽在肿瘤细胞中引起的转录组改变。

【数据结构与技术规格】

文件数 1 个,合计 0 B。

【主题与分类】

主题标签:GPL16791、9606。本站分类:肿瘤/脑肿瘤。

【获取与许可】

源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE231577

【使用注意】

· 源站最后修改于 Sep 25 202,引用时请注意版本时效。

官方服务

专家保障全链路合规授权与标注交付

陕川双基地 × 超十家三甲医院直连

从合规授权、采集治理、专业标注到数据集交付,我们提供全链路闭环服务,让高质量临床数据即拿即用。

⚡️ 需要原始数据或标注支持?联系我们获取定制方案。

帮我联系

下载信息

注册下载

需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。

暂未开放

公开下载

无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。

免登录

当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。

免费样本无法满足模型训练要求?千方提供经三甲医院脱敏、带病理回证与专家标注的商业级专病数据集。

使用方式

数据集获取

源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE231577

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

该数据集包括经对照肽K59-78TAT或设计肽K90-114TAT治疗的异种移植GBM肿瘤(G411)荷瘤NSG小鼠模型的原始单细胞RNAseq数据,以及经对照肽K59-78TAT或设计肽K90-114TAT治疗的GBM细胞(G411)与神经元共培养模型的原始批量RNAseq数据。在本项目中,我们重点研究了设计肽引起的肿瘤细胞转录组改变。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。

需要用于商业化训练或医疗器械注册(NMPA/FDA)?

公开数据往往缺乏完整的病理回证与专家标注。千方医数集依托陕川双基地与超十家三甲医院直连,提供完全合规、去标识化、支持注册级质控的专病数据集交易服务。