药物与单细胞基因表达整合识别胶质母细胞瘤敏感和耐药细胞群

该数据集为NCBI GEO上的SuperSeries(GSE231490),主题为通过药物与单细胞基因表达数据整合来识别胶质母细胞瘤中对药物敏感和耐药的细胞群体

geo
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基因组分类GPL185739606
GSE231490: Drug and single-cell gene expression integration identifies sensitive and resistant glioblastoma cell populations

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-24

资源简介

药物与单细胞基因表达整合识别胶质母细胞瘤敏感和耐药细胞群

GSE231490 是 NCBI GEO 上的一个 SuperSeries,主题为通过药物数据与单细胞基因表达数据的整合,识别胶质母细胞瘤中对药物敏感和耐药的细胞群体。该数据集归属于肿瘤 / 脑肿瘤分类,由 Robert K. Suter 提交,发布时间为 2024 年 5 月 2 日(源站记录为 May 02 202),包含 1 个数据文件,样例文件为 GSE231490_series_matrix.txt.gz。数据集采用高通量测序的表达谱分析策略,涉及平台 GPL18573 与物种编号 9606,适合围绕胶质母细胞瘤细胞群体异质性及药物敏感性差异开展表达层面的探索。

【数据集背景】

胶质母细胞瘤是脑肿瘤中异质性突出的类型,不同细胞群体对药物的反应可能存在明显差异。该数据集以药物信息与单细胞基因表达数据的整合为切入点,目标在于区分对药物敏感与耐药的胶质母细胞瘤细胞群体,为理解肿瘤内部细胞状态差异提供表达谱层面的数据基础。源站标题与数据集名称一致,均指向这一研究主题。

【数据内容】

该数据集为 SuperSeries,源站描述说明其由若干 SubSeries 组成,具体子系列信息源站未提供。数据集包含 1 个文件,样例文件名为 GSE231490_series_matrix.txt.gz,属于系列矩阵文件形式。主题标签涵盖高通量测序表达谱分析、平台 GPL18573 以及物种编号 9606。除上述信息外,样本数量、分组设计、具体基因或细胞群体列表等内容源站未提供。

【采集与来源】

数据来源于 NCBI GEO(ncbi.nlm.nih.gov),提交者为 Robert K. Suter,发布时间为 2024 年 5 月 2 日。数据集采用高通量测序技术获取表达谱信息,平台标识为 GPL18573,物种为 9606(人类)。关于样本采集地点、伦理审批、实验批次等细节,源站未提供。

【适用场景】

该数据集适用于胶质母细胞瘤细胞群体异质性研究,尤其是结合药物信息分析敏感与耐药细胞群体的表达特征;也可用于单细胞基因表达数据与药物数据整合方法的验证与比较。由于其为 SuperSeries,还可作为定位相关子系列的入口。具体分析场景的可行性需结合完整数据内容判断,源站未提供更细化的适用说明。

【使用方法】

使用时可先下载数据文件 GSE231490_series_matrix.txt.gz,该文件为 GZIP 压缩格式。建议先在小样本上核对字段结构与编码方式,确认无误后再批量接入后续分析流程。由于数据集为 SuperSeries,实际分析时可能还需关注其下属 SubSeries 的数据组织方式,具体子系列信息源站未提供。

【质量与限制】

该数据集仅包含 1 个文件,且源站描述较为简略,未提供样本量、数据完整性评估、质控指标等信息。作为 SuperSeries,其主体数据分布在子系列中,单独使用系列矩阵文件可能不足以覆盖全部研究内容。相关限制的详细说明源站未提供。

【引用与许可】

数据提交者为 Robert K. Suter,引用时应注明数据集编号 GSE231490 及来源 NCBI GEO。关于许可条款与使用限制,源站未提供。

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使用方式

数据集获取

源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE231490

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

This SuperSeries is composed of the SubSeries listed below.

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