GSE224727：胶质母细胞瘤中细胞状态特异的GPX4依赖性铁死亡代谢脆弱性

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE224727

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

胶质瘤细胞劫持发育转录程序以控制细胞状态。在神经发育过程中，谱系轨迹依赖于特化的代谢途径。然而，肿瘤细胞状态与代谢程序之间的联系在胶质瘤中尚知之甚少。在此，我们揭示了一种胶质瘤细胞状态特异性的代谢脆弱性，可利用其进行治疗。为模拟胶质瘤细胞状态的多样性，我们构建了基因工程小鼠胶质瘤模型，分别由单独敲除p53（p53）或联合组成性激活Notch信号（N1IC）诱导——Notch信号是控制中枢神经系统细胞命运的关键通路。N1IC肿瘤具有静息型星形胶质细胞样转化细胞状态，而p53肿瘤则由增殖型祖细胞样细胞状态组成。N1IC细胞表现出独特的代谢改变，线粒体解偶联和ROS产生增加使其对脂质过氧化物酶GPX4的抑制及铁死亡诱导更为敏感。重要的是，用GPX4抑制剂处理患者来源的器官型切片，可选择性清除具有相似代谢特征的静息型AC样胶质瘤细胞群体。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。