OGDH功能缺失与Bcl-xL在胶质母细胞瘤中的合成致死相互作用

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE223297

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

胶质母细胞瘤（GBM）仍是一种无法治愈的疾病，需要更有效的治疗方法。通过CRISPR和RNAi文库筛选研究，我们确定了若干三羧酸循环（TCA循环）酶对GBM生长至关重要。结合转录组和代谢物筛选分析，我们发现，经临床验证的药物化合物CPI-613导致OGDH功能丧失后，与Bcl-xL抑制（通过遗传学手段及经临床验证的BH3模拟物ABT263）在患者来源的异种移植模型以及神经球GBM培养中表现出合成致死效应。CPI-613介导的能量剥夺驱动整合应激反应，并以ATF4依赖的方式上调BH3-only结构域蛋白Noxa，这一点已通过遗传功能丧失实验证实。一致地，在GBM模型系统中，沉默Noxa可挽救由CPI-613诱导的细胞死亡。在小鼠GBM患者来源的异种移植模型中，ABT263与CPI-613联合治疗对肿瘤生长的抑制作用比单独使用每种化合物更强。因此，联合抑制Bcl-xL并干扰TCA循环可能是一种新的GBM治疗策略。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。