负载光动力疗法杀伤胶质瘤的DC疫苗诱导Th17抗肿瘤免疫并提供胶质瘤预后4基因特征

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE218081

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

胶质瘤是成人中枢神经系统最常见的原发性肿瘤，具有显著的发病率和死亡率。尽管新型、复杂、多学科和靶向治疗不断发展，但胶质瘤治疗在过去几十年中并未取得太大进展。因此，迫切需要开发新的、根据患者调整的免疫疗法，主动刺激抗肿瘤T细胞产生长期记忆，从而带来显著的临床获益。本研究旨在探讨负载经光敏剂光动力疗法（PS-PDT）诱导免疫原性细胞死亡（ICD）的胶质瘤细胞的树突状细胞（DC）疫苗的疗效和分子机制，并确定可靠的预后基因特征以预测患者的总生存期（OS）。对基于ICD的DC疫苗转录程序的分析确定了其作为疫苗使用时Th17特征的强烈诱导，这些DC在原位小鼠模型中显示出维甲酸受体相关孤儿受体-γt依赖性疗效。

此外，通过将基于ICD的DC疫苗的转录组程序与TCGA低级别胶质瘤（LGG）数据集的转录组数据进行对比分析，已鉴定出与胶质瘤患者总生存期（OS）相关的四基因特征（CFH、GALNT3、SMC4、VAV3）。该模型已在CGGA-LGG、TCGA-胶质母细胞瘤（GBM）和CGGA-GBM数据集的OS中得到验证，以确定其是否具有相似的预后价值。为此，通过计算时间依赖性受试者工作特征（ROC）曲线的曲线下面积（AUC），评估了该预后模型预测OS的敏感性和特异性。对于TCGA-LGG、CGGA-LGG、TCGA-GBM和CGGA-GBM，预测5年生存率的AUC值分别为0.75、0.73、0.9和0.69。这些数据为通过采用基于ICD和PS-PDT的DC疫苗诱导

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。