GSE208773:替莫唑胺与二甲双胍辅助治疗胶质母细胞瘤机制探索
该数据集来自 NCBI GEO,标题为探索替莫唑胺与二甲双胍辅助治疗胶质母细胞瘤的机制,属于肿瘤/脑肿瘤分类。源站描述指出其用于研究对照组与二甲双胍处理胶质母细胞瘤细胞系之间转录组及相关信号的变化,可用于分析二甲双胍对胶质母细胞瘤细胞转录组的影响(来源 NCBI)

基本信息
资源简介
GSE208773:替莫唑胺与二甲双胍辅助治疗胶质母细胞瘤机制探索
GSE208773 数据集来自 NCBI GEO,标题为“Exploring the Mechanism of Adjuvant Treatment of Glioblas-toma Using Temozolomide and Metformin”,中文可理解为探索替莫唑胺与二甲双胍辅助治疗胶质母细胞瘤的机制。该数据集归入肿瘤/脑肿瘤分类,围绕胶质母细胞瘤细胞系在二甲双胍处理条件下的转录组变化展开,旨在比较对照组与处理组之间转录组及相关信号通路的差异。数据集以高通量测序表达谱为主要内容,包含一个可供下载的系列矩阵文件,适合用于分析二甲双胍对胶质母细胞瘤细胞转录组的影响,并为相关辅助治疗机制研究提供表达层面的数据参考。
【数据集背景】
胶质母细胞瘤是脑肿瘤研究中的重要对象,辅助治疗机制的探索对理解药物作用方式具有意义。该数据集关注替莫唑胺与二甲双胍在胶质母细胞瘤辅助治疗中的机制,源站描述明确指出其研究目的是考察对照组与二甲双胍处理的胶质母细胞瘤细胞系之间转录组及相关信号的变化。数据集标题同时提及替莫唑胺与二甲双胍,但源站描述所强调的比较对象为对照组与二甲双胍处理组,具体实验分组细节源站未提供。
【数据内容】
该数据集的主题标签包括“Expression profiling by high throughput sequencing”,表明其数据属于高通量测序表达谱类型;同时标注了 GPL21697 平台信息与物种编号 9606。数据集文件数量为 1,文件样例为 GSE208773_series_matrix.txt.gz,即以 GZIP 压缩形式提供的系列矩阵文件。该文件通常承载样本层面的表达谱矩阵信息,可用于查看样本与基因层面的组织方式。数据集中涉及的具体样本数量、基因数量、测序深度等细节源站未提供。
【采集与来源】
数据集来源站为 ncbi.nlm.nih.gov,属于 NCBI GEO 公共数据库资源。作者信息记为 Yao,F,Li,发布时间为 Jul 21 202。源站描述说明研究比较对照组与二甲双胍处理的胶质母细胞瘤细胞系之间的转录组与相关信号变化。关于样本采集地点、细胞系具体名称、处理浓度与时长、测序平台运行参数等实验条件,源站未提供。
【适用场景】
该数据集可用于分析二甲双胍对胶质母细胞瘤细胞转录组的影响,适合作为表达谱层面的探索性数据,用于比较对照组与处理组之间的转录组差异,并围绕相关信号变化开展机制假设的初步分析。由于主题标签指向高通量测序表达谱,其典型用途包括差异表达分析、样本间表达模式比较等。涉及替莫唑胺的具体联合处理效应,源站描述未展开,相关分析需以数据实际内容为准。
【使用方法】
使用时可先下载数据文件 GSE208773_series_matrix.txt.gz,按 GZIP 压缩包格式读取。建议先在小样本上核对字段与编码,确认无误后再批量接入,以避免因文件结构或编码问题导致批量处理错误。读取后可结合样本分组信息开展表达谱比较分析;由于数据集仅提供一个系列矩阵文件,分析时应以该文件所包含的字段为准。具体分析流程与参数设置需依据研究目的确定,源站未提供配套分析脚本或流程说明。
【质量与限制】
该数据集文件数量为 1,主要以系列矩阵形式提供,未包含原始测序读段文件,因而在原始数据质控与重分析方面的灵活性有限。源站描述较为简短,未提供样本量、重复数、处理条件等关键实验细节,使用者在解释结果时需注意这些信息的缺失。数据集的发布时间记为 Jul 21 202,年份信息不完整,引用时应以源站记录为准。关于数据质量评估指标,源站未提供。
【引用与许可】
该数据集来自 NCBI GEO,作者为 Yao,F,Li,标题为“Exploring the Mechanism of Adjuvant Treatment of Glioblas-toma Using Temozolomide and Metformin”。使用时应遵循 NCBI GEO 的引用规范并注明数据集编号 GSE208773。关于该数据集的具体许可条款与使用限制,源站未提供。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE208773
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
研究对照与二甲双胍处理的胶质母细胞瘤细胞系之间转录组及相关信号传导的变化。
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