姜黄素类似物处理人胶质母细胞瘤细胞后的转录组变化
该数据集来自 NCBI,记录人胶质母细胞瘤细胞经姜黄素类似物 CCA-1.1 处理后的 mRNA 表达变化,采用高通量测序进行表达谱分析

基本信息
资源简介
姜黄素类似物处理人胶质母细胞瘤细胞后的转录组变化
GSE206241 数据集来自 NCBI,主题为“Transcriptome changes after curcumin analog treatment in human glioblastoma cells”,即人胶质母细胞瘤细胞经姜黄素类似物处理后的转录组变化。该数据集记录的是胶质母细胞瘤细胞在接受姜黄素类似物 CCA-1.1 处理后,通过 mRNA 测序获得的基因表达谱,属于肿瘤与脑肿瘤研究方向。数据集由 Adam 与 Hermawan 提交,发布时间为 Jun 16 202,包含 1 个数据文件,样例文件为 GSE206241_series_matrix.txt.gz。整体来看,该数据集以高通量测序为手段,围绕姜黄素类似物干预下胶质母细胞瘤细胞的 mRNA 表达变化展开,适合用于表达谱层面的观察与分析。
【数据集背景】
胶质母细胞瘤是脑肿瘤研究中的重要对象,针对其细胞模型的转录组研究有助于了解药物或化合物干预后的基因表达响应。该数据集关注姜黄素类似物 CCA-1.1 处理人胶质母细胞瘤细胞后的转录组变化,源站描述指出,细胞经 CCA-1.1 处理后,通过 mRNA 测序分析 mRNA 表达。数据集的主题标签包括 Expression profiling by high throughput sequencing、GPL20301 和 9606,分别指向高通量测序表达谱分析、平台信息以及人类物种信息。本站将其归类为肿瘤 / 脑肿瘤,与其研究对象和疾病背景一致。
【数据内容】
该数据集的核心内容是姜黄素类似物处理后人胶质母细胞瘤细胞的 mRNA 表达谱。源站描述说明,实验对胶质母细胞瘤细胞进行 CCA-1.1 处理,并采用 mRNA 测序分析 mRNA 表达。数据集包含 1 个文件,样例文件名为 GSE206241_series_matrix.txt.gz,属于 GZIP 压缩格式。主题标签中的 GPL20301 与 9606 分别对应数据集所涉及的高通量测序平台和人类物种信息。除上述信息外,源站未提供更细化的样本数量、分组设计、测序读长或表达矩阵字段说明。
【采集与来源】
该数据集来源于 ncbi.nlm.nih.gov,源站标题为“Transcriptome changes after curcumin analog treatment in human glioblastoma cells”。数据由 Adam 和 Hermawan 提交,发布时间为 Jun 16 202。采集方式为对经姜黄素类似物 CCA-1.1 处理的人胶质母细胞瘤细胞进行 mRNA 测序,以获得表达谱数据。数据集的主题标签表明其属于高通量测序表达谱分析,并涉及人类样本信息。除这些来源与采集描述外,源站未提供更详细的实验地点、样本处理流程或测序仪器配置信息。
【适用场景】
该数据集适用于围绕胶质母细胞瘤细胞在姜黄素类似物 CCA-1.1 干预下 mRNA 表达变化开展的分析,例如表达谱层面的差异观察、转录组响应模式探讨,以及与其他脑肿瘤或肿瘤表达谱数据的对照研究。由于主题标签包含高通量测序表达谱分析,该数据也可用于方法学层面的表达谱数据处理练习。需要说明的是,具体分析场景应结合数据实际内容进行判断,源站未提供关于分析用途的进一步说明。
【使用方法】
使用该数据集时,可先下载数据文件 GSE206241_series_matrix.txt.gz,并按 GZIP 压缩包格式进行读取。建议先在小样本上核对字段与编码,确认无误后再批量接入后续分析流程。由于数据集仅包含 1 个文件,使用时应以该文件为主要数据入口,结合其表达谱内容开展读取与整理。源站未提供更详细的数据读取参数、字段字典或分析脚本说明。
【质量与限制】
该数据集包含 1 个文件,样例为 GSE206241_series_matrix.txt.gz,采用 GZIP 压缩格式。源站描述较为简要,仅说明细胞经 CCA-1.1 处理后进行 mRNA 测序并分析 mRNA 表达。关于样本数量、重复设置、测序深度、数据质控指标以及表达矩阵的具体字段,源站未提供。因此,在使用该数据集时,应首先核对文件内容与字段编码,并在小样本上确认数据可读性后再进行批量处理。数据集的发布时间为 Jun 16 202,其余时间与版本信息源站未提供。
【引用与许可】
该数据集由 Adam 和 Hermawan 提交,来源站为 ncbi.nlm.nih.gov,源站标题为“Transcriptome changes after curcumin analog treatment in human glioblastoma cells”。关于该数据集的引用方式与许可条款,源站未提供。使用者在引用或再利用该数据时,应另行查阅源站的相关说明。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。
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公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE206241
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
Glioblastoma cells were treated with curcumin analog CCA-1.1 and analyzed mRNA expression through mRNA sequencing
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