胶质母细胞瘤细胞中SPRK1 shRNA与过表达后的RNA-seq
SRPK1是SR蛋白激酶，可磷酸化剪接体核心组分及辅助剪接因子，调控人类细胞剪接事件。由于神经系统mRNA可变剪接频繁，mRNA异构体失衡会影响重要神经蛋白功能
基本信息
资源简介
胶质母细胞瘤细胞中SPRK1 shRNA与过表达后的RNA-seq
SPRK1 shRNA and overexpression followed by RNA-seq in glioblastoma cells
该数据集来自NCBI GEO，标题为SPRK1 shRNA and overexpression followed by RNA-seq in glioblastoma cells，收录胶质母细胞瘤细胞中经SRPK1基因敲低和过表达处理后的RNA-seq数据。SRPK1是SR蛋白激酶，可磷酸化剪接体核心组分及辅助剪接因子，调控人类细胞剪接事件。由于神经系统mRNA可变剪接频繁，mRNA异构体失衡会影响重要神经蛋白功能。该数据可用于在胶质母细胞瘤细胞中分类SRPK1遗传调控后的剪接事件，研究SRPK1作为治疗靶点的作用（来源 NCBI）。
【数据集背景】
源站首次发布：May 17 202。
【数据内容】
源站描述（机器翻译，仅供参考）：SRPK1是一种SR（丝氨酸-精氨酸）蛋白激酶，正逐渐被视为治疗靶点。SRPK1磷酸化SR家族核心剪接体组分和辅助剪接因子，是人类细胞中剪接事件的关键调控因子。由于神经系统中mRNA的可变剪接发生频率很高，mRNA异构体的失衡会影响重要神经蛋白的功能。我们使用该RNA-seq数据集来分类胶质母细胞瘤细胞中SRPK1遗传调控后的剪接事件。
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个，合计 0 B。
【主题与分类】
主题标签：GPL11154、9606。本站分类：肿瘤/脑肿瘤。
【获取与许可】
源站页面：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE203177
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pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
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- OpenDataLab:
数据说明
SRPK1是一种SR（丝氨酸-精氨酸）蛋白激酶，正逐渐成为治疗靶点。SRPK1能磷酸化核心剪接体组分及辅助剪接因子中的SR家族，是人类细胞剪接事件的关键调节因子。由于神经系统中mRNA的可变剪接发生频率很高，mRNA异构体的失衡会影响重要神经蛋白的功能。我们利用该RNA-seq数据集，对胶质母细胞瘤细胞中遗传调控SRPK1后的剪接事件进行了分类。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
需要用于商业化训练或医疗器械注册（NMPA/FDA）？
公开数据往往缺乏完整的病理回证与专家标注。千方医数集依托陕川双基地与超十家三甲医院直连，提供完全合规、去标识化、支持注册级质控的专病数据集交易服务。
