间充质胶质母细胞瘤中异常L-岩藻糖积累与核心岩藻糖基化增强的代谢脆弱性

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE202200

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数据说明

胶质母细胞瘤（GBM）是成人中最致命的脑肿瘤，其代谢失调为将代谢干预作为精准治疗策略提供了契机。为识别GBM不同分子亚群利用代谢重编程维持肿瘤进展的分子驱动因素及方式，我们探究了人亚群特异性GBM干细胞（GSCs）的转录组、代谢组和糖蛋白组。在此我们报告，L-岩藻糖丰度和核心岩藻糖基化激活在间充质（MES）型GSCs中比在前神经（PN）型GSCs中增强更为显著；这一模式在亚群特异性异种移植瘤中得以保留，并且最重要的是，在亚群相关的人类患者样本中得以重现。在MES GBM临床前模型中，对核心岩藻糖基化进行遗传学和药理学抑制可显著减轻肿瘤负荷。基于LC/MS的糖蛋白组学筛选表明，大多数MES限制性核心岩藻糖基化蛋白参与具有治疗相关性的GBM病理过程，如细胞外基质相互作用、细胞黏附和整合素介导的信号传导。

值得注意的是，临床前微创正电子发射断层扫描（PET）显示，L-岩藻糖在MES型胶质母细胞瘤（GBM）中选择性蓄积，提示该代谢物可能是一种亚组限制性生物标志物。总体而言，这些发现表明，MES型GBM中L-岩藻糖通路的激活提供了亚组特异性、GSC限制性的依赖性，可作为诊断标志物和可干预的治疗靶点加以利用。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。