人胶质母细胞瘤细胞系A172中RBFOX1过表达数据集

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE201639

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

本研究旨在探究癌症中基因表达转录后变化，尤其是mRNA稳定性变化背后的调控事件。我们观察到，在胶质母细胞瘤中RBFOX1靶标的稳定性降低，鉴于已知RBFOX1可稳定其靶标mRNA，我们推测RBFOX1的下调至少部分导致了胶质母细胞瘤转录组的改变。我们在A172人胶质母细胞瘤细胞系中过表达RBFOX1，并对提取的RNA进行RNA测序。我们计算了过表达RBFOX1的细胞系相较于对照样本的差异基因表达。我们证实，RBFOX1过表达导致RBFOX1调控子上调，包括在肿瘤中不稳定的绝大多数RBFOX1靶标。结果表明，胶质母细胞瘤中RBFOX1的下调导致其靶标不稳定，而通过过表达RBFOX1可部分挽救这一现象。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。