GSE197508：揭示参与胶质瘤癌变的小非编码RNA
该数据集来自 NCBI GEO，聚焦胶质母细胞瘤（GBM）癌变相关的小非编码 RNA。研究对 U87-MG GBM 细胞系进行小 RNA 与转录组的高通量下一代测序，鉴定出已知和新的 piRNA、miRNA，以及蛋白编码基因、lncRNA 和假基因转录本
基本信息
资源简介
GSE197508：揭示参与胶质瘤癌变的小非编码RNA
Uncovering small non-coding RNAs involved in carcinogenesis of Glioma
该数据集来自 NCBI GEO，聚焦胶质母细胞瘤（GBM）癌变相关的小非编码 RNA。研究对 U87-MG GBM 细胞系进行小 RNA 与转录组的高通量下一代测序，鉴定出已知和新的 piRNA、miRNA，以及蛋白编码基因、lncRNA 和假基因转录本。数据可用于探索这些小 RNA 及其靶转录组所涉及的信号通路，进而解析 GBM 肿瘤发生的分子机制（来源 NCBI）。
【数据集背景】
源站首次发布：Feb 26 202。
【数据内容】
源站描述（机器翻译，仅供参考）：为确定小 RNA（piRNA、miRNA）通过靶向调控影响胶质母细胞瘤（GBM）的哪些信号通路，我们对 U87-MG GBM 细胞系进行了高通量下一代测序。小 RNA 和转录组的 RNA 测序（RNA-Seq）发现了已知和新的 piRNA 与 miRNA，以及该 GBM 细胞系中表达的其他蛋白编码基因、lncRNA 和假基因转录组。这些小 RNA 和靶转录组可进一步研究，以解析该恶性肿瘤肿瘤发生背后的新分子机制。
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个，合计 0 B。
【主题与分类】
主题标签：GPL16791、9606。本站分类：肿瘤/脑肿瘤。
【获取与许可】
源站页面：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE197508
【使用注意】
· 源站最后修改于 Jul 04 202，引用时请注意版本时效。
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pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
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- OpenDataLab:
数据说明
为确定小RNA（piRNA、miRNA）通过靶向调控在胶质母细胞瘤（GBM）中影响哪些信号通路，我们在U87-MG GBM细胞系中进行了高通量下一代测序。小RNA和转录组的RNA测序（RNA-Seq）发现了已知和新的piRNA和miRNA，以及在该GBM细胞系中表达的其他蛋白质编码基因、lncRNA和假基因的转录组。这些small RNA和靶转录组可进一步研究，以解读该恶性肿瘤肿瘤发生背后的新分子机制。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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