细胞内组成型活性TrkB(NTRK2)激酶结构域及纯细胞内NTRK2融合癌基因介导的非典型细胞反应

该数据集来自NCBI GEO,采用RNA-seq对稳定表达TrkB的U87MG胶质母细胞瘤细胞系进行转录组分析,涵盖九种测试条件、四个独立mRNA制备样本,每个样本约4000万条唯一reads

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基因组分类GPL301739606
GSE186207: Atypical cellular responses mediated by intracellular constitutive active TrkB (NTRK2) kinase domains and a solely intracellular NTRK2-fusion oncogene

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-08

资源简介

细胞内组成型活性TrkB(NTRK2)激酶结构域及纯细胞内NTRK2融合癌基因介导的非典型细胞反应

Atypical cellular responses mediated by intracellular constitutive active TrkB (NTRK2) kinase domains and a solely intracellular NTRK2-fusion oncogene

该数据集来自NCBI GEO,采用RNA-seq对稳定表达TrkB的U87MG胶质母细胞瘤细胞系进行转录组分析,涵盖九种测试条件、四个独立mRNA制备样本,每个样本约4000万条唯一reads。数据可用于研究TrkB通过Y705位点自激活后对肌动蛋白动态和细胞迁移的抑制作用,以及自激活引发的转录重编程和免疫应答、防御机制相关基因的激活,为胶质母细胞瘤分子特征研究提供转录组资源(来源 NCBI)。

【数据集背景】

源站首次发布:Oct 20 202。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):我们报告应用RNA-seq对稳定表达TrkB的培养U87MG细胞进行分子谱分析。我们的数据集基于每个样本约4000万条唯一reads,来自四个独立mRNA制备样本,涵盖九种不同测试条件。U87MG是一种标准的人胶质母细胞瘤患者来源细胞系,可作为研究胶质母细胞瘤分子特征的细胞模型。我们在研究中描述了TrkB通过Y705位点的细胞内自激活及其在降低肌动蛋白动态和细胞迁移中的作用。借助该转录组数据集,我们希望突出TrkB自激活后被激活的关键因子。该数据集提示在修饰后的U87MG细胞中发生了转录水平重编程,并开启了一些在调节免疫应答和防御机制中发挥作用的基因。

【数据结构与技术规格】

文件数 1 个,合计 0 B。

【主题与分类】

主题标签:GPL30173、9606。本站分类:肿瘤/脑肿瘤。

【获取与许可】

源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE186207

【使用注意】

· 源站最后修改于 Oct 10 202,引用时请注意版本时效。

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    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

我们报告了应用RNA-seq对稳定表达TrkB的培养U87MG细胞进行分子谱分析的研究。我们的数据集基于每个样本约4000万条唯一读数,来自四种独立的mRNA制备,涵盖九种不同的测试条件。U87MG是一种标准的人胶质母细胞瘤患者来源细胞系,作为研究胶质母细胞瘤分子特征的细胞模型。在我们的研究中,我们描述了TrkB通过Y705位点的细胞内自我激活及其在降低肌动蛋白动态和细胞迁移中的作用。借助此转录组数据集,我们希望突出显示TrkB自我激活后被激活的关键因素。该数据集表明,在改造后的U87MG细胞中,发生了转录水平的重编程,并开启了一些在调节免疫反应和防御机制中发挥作用的基因。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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