胶质母细胞瘤与非肿瘤脑组织基因表达比较
研究回顾性量化关键修复基因表达并与总体生存(OS)关联,差异表达分析发现 7 个修复基因在 GBM 组织中显著上调(差异 > 4 倍,校正 p 值均 < 0.001),其中 RAD51 与死亡风险增加相关(HR = 3.49;p = 0.03),高 RAD51 患者中位 OS 为 10.6 个月,低

基本信息
资源简介
胶质母细胞瘤与非肿瘤脑组织基因表达比较
Gene expression comparison between glioblastoma and non-neoplastic brain tissue samples using NanoString nCounter Pan-Cancer Pathways Panel
该数据集来自 NCBI,比较胶质母细胞瘤(GBM)组织与非肿瘤脑组织的基因表达,使用 NanoString nCounter Pan-Cancer Pathways Panel。研究回顾性量化关键修复基因表达并与总体生存(OS)关联,差异表达分析发现 7 个修复基因在 GBM 组织中显著上调(差异 > 4 倍,校正 p 值均 < 0.001),其中 RAD51 与死亡风险增加相关(HR = 3.49;p = 0.03),高 RAD51 患者中位 OS 为 10.6 个月,低于低水平者的 20.1 个月(log-rank p = 0.03)。数据可用于 GBM 修复基因表达与预后分析(来源 NCBI)。
【数据集背景】
源站首次发布:Oct 18 202。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):胶质母细胞瘤(GBM)的大多数治疗失败发生在高剂量辐射野内,部分原因是 DNA 损伤修复能力增强。我们回顾性量化了 GBM 组织样本中关键修复基因的表达水平,并将这些表达水平与总体生存(OS)相关联。差异表达分析鉴定出 7 个修复基因在 GBM 组织中相对于对照组显著上调(差异 > 4 倍,且所有校正 p 值 < 0.001)。在这 7 个基因中,Cox 比例风险模型鉴定出 RAD51 与死亡风险增加相关(HR = 3.49;p = 0.03)。Kaplan-Meier(KM)分析还表明,RAD51 高表达患者的 OS 显著短于低表达患者(中位 OS 为 10.6 个月 vs 20.1 个月,log-rank p = 0.03)。这些发现随后在一个更大的外
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个,合计 0 B。
【主题与分类】
主题标签:Expression profiling by array、GPL30873、9606。本站分类:肿瘤/脑肿瘤。
【获取与许可】
源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE186057
【使用注意】
· 源站最后修改于 Feb 10 202,引用时请注意版本时效。
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- OpenDataLab:
数据说明
胶质母细胞瘤(GBM)的大多数治疗失败发生在大剂量辐射野内,部分原因是DNA损伤修复能力增强。我们回顾性地量化了GBM组织样本中关键修复基因的表达水平,并将这些表达水平与总生存期(OS)相关联。差异表达分析发现,与对照组相比,GBM组织中有7个修复基因显著上调(差异>4倍,所有校正p值<0.001)。在这7个基因中,Cox比例风险模型确定RAD51与死亡风险增加相关(HR=3.49;p=0.03)。Kaplan-Meier(KM)分析还表明,RAD51水平高的患者与水平低的患者相比,OS显著缩短(中位OS为10.6个月 vs 20.1个月,对数秩p=0.03)。这些发现随后在一个包含162名患者的更大的外部数据集中得到验证,该数据集使用了由相同NanoString技术量化的公开可用的基因表达数据(中位OS为13.8个月 vs. 17.4个月;对数秩p=0.006)。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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需要用于商业化训练或医疗器械注册(NMPA/FDA)?
公开数据往往缺乏完整的病理回证与专家标注。千方医数集依托陕川双基地与超十家三甲医院直连,提供完全合规、去标识化、支持注册级质控的专病数据集交易服务。




