GSE185695:LncRNA INHEG 通过调控 rRNA 2'-O 甲基化促进胶质瘤干细胞维持与致瘤性
源站描述聚焦 lncRNA INHEG 在胶质瘤干细胞中的高表达及其通过调控 rRNA 2'-O 甲基化促进干细胞自我更新和致瘤性的机制

基本信息
资源简介
GSE185695:LncRNA INHEG 通过调控 rRNA 2'-O 甲基化促进胶质瘤干细胞维持与致瘤性
LncRNA INHEG promotes glioma stem cell maintenance and tumorigenicity through regulating rRNA 2’-O methylation
该数据集来自 NCBI GEO(GSE185695),包含 1 个文件 GSE185695_series_matrix.txt.gz,采用高通量测序进行表达谱分析,物种为人类(9606),平台为 GPL18573。源站描述聚焦 lncRNA INHEG 在胶质瘤干细胞中的高表达及其通过调控 rRNA 2'-O 甲基化促进干细胞自我更新和致瘤性的机制。数据可用于研究胶质母细胞瘤中 lncRNA 与 rRNA 甲基化、snoRNP 组装及致癌蛋白翻译之间的关联,为潜在治疗靶点探索提供表达谱基础(来源 NCBI)。
【数据集背景】
源站首次发布:Oct 12 202。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):胶质母细胞瘤(GBM)是人类最致命的癌症之一,其中包含具有治疗抵抗性的胶质瘤干细胞(GSCs)。在此,我们报告,与分化胶质瘤细胞(DGCs)相比,lncRNA INHEG 在 GSCs 中高表达,并通过控制 rRNA 2'-O 甲基化促进 GSC 自我更新。INHEG 诱导一种新型 SUMO E3 连接酶 TAF15 与 NOP58(引导 rRNA 甲基化的 snoRNP 核心组分)之间的相互作用,以调节 NOP58 的 sumoylation 并加速 C/D box snoRNP 组装。INHEG 激活增强 rRNA 2'-O 甲基化,从而增加胶质瘤细胞中包括 EGFR 和 IGF1R 在内的致癌蛋白的翻译。综上所述,本研究鉴定了一种 lncRNA,它将 snoRNP 引导的 rRNA 2'-O 甲基化与 GSCs 中上调的蛋白翻译联系起来,为胶质瘤的潜在治疗靶向提供了新的轴线。
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个,合计 0 B。
【主题与分类】
主题标签:GPL18573、9606。本站分类:肿瘤/脑肿瘤。
【获取与许可】
源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE185695
【使用注意】
· 源站最后修改于 Dec 08 202,引用时请注意版本时效。
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- OpenDataLab:
数据说明
胶质母细胞瘤(GBM)是人类最致命的癌症之一,其中包含具有治疗抵抗性的胶质瘤干细胞(GSCs)。在此,我们报道长链非编码RNA INHEG在GSCs中相较于分化胶质瘤细胞(DGCs)高表达,并通过调控rRNA 2’-O-甲基化促进GSC自我更新。INHEG诱导新型SUMO E3连接酶TAF15与NOP58(引导rRNA甲基化的snoRNP核心组分)之间的相互作用,以调节NOP58的SUMO化并加速C/D盒snoRNP组装。INHEG的激活增强了rRNA 2’-O-甲基化,从而增加了胶质瘤细胞中包括EGFR和IGF1R在内的致癌蛋白的翻译。综上所述,本研究鉴定了一种lncRNA,它将snoRNP引导的rRNA 2’-O-甲基化与GSCs中上调的蛋白翻译联系起来,为胶质瘤的潜在治疗靶向提供了新的轴心。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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公开数据往往缺乏完整的病理回证与专家标注。千方医数集依托陕川双基地与超十家三甲医院直连,提供完全合规、去标识化、支持注册级质控的专病数据集交易服务。




