GSE171872：CD169是脑肿瘤中IFN-γ刺激的炎性巨噬细胞标志物[WG vs TG]

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE171872

标准获取流程：

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   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
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     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

针对多形性胶质母细胞瘤(GBM)的治疗在很大程度上无效，原因在于免疫抑制性肿瘤相关巨噬细胞(TAMs)的浸润。近期研究表明，TAMs 也可具有免疫激活作用。然而，区分这些异质性巨噬细胞群体的标志物尚未确立。在本研究中，我们鉴定出一个表达 CD169 的巨噬细胞亚群，该亚群在 GBM 中促进抗肿瘤微环境。通过单细胞转录组分析，我们发现人和小鼠胶质瘤中的 CD169+ 巨噬细胞产生促炎趋化因子，导致 T 细胞和 NK 细胞的积聚。清除 CD169+ 巨噬细胞缩短了胶质瘤小鼠的生存期，并降低了抗肿瘤淋巴细胞的功能。我们证明，NK 细胞产生的 IFN-γ 对于 CD169+ 巨噬细胞积聚至胶质瘤中至关重要。此外，巨噬细胞上的 CD169 表达增加了对凋亡胶质瘤细胞的吞噬作用。我们的发现表明，TAMs 的 CD169+ 亚群促进针对 GBM 的抗肿瘤免疫应答。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。