G207溶瘤单纯疱疹病毒接种前后人胶质母细胞瘤切除组织的RNA测序（Ib期临床试验）

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE162643

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

我们此前已开发出使用基因工程改造的1型单纯疱疹病毒（“G207”）对恶性胶质瘤进行实验性治疗的方法（PMID: 18957964）。我们已证明，G207可在神经系统肿瘤细胞中增殖并将其杀死，且几乎无病毒性脑炎的迹象。在本研究中，我们招募了六名复发性胶质母细胞瘤成年患者参加一项Ib期临床试验，以检验G207在抗肿瘤反应中的安全性和有效性。我们获取了接种G207之前及之后（2-5天内）切除的肿瘤组织。从所有组织中提取RNA，并对其进行文库制备，以便在Illumina仪器上进行RNA测序。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。