BRD8通过P53网络表观遗传重编程维持胶质母细胞瘤[RNA-seq]

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BRD8通过P53网络表观遗传重编程维持胶质母细胞瘤[RNA-seq]

GSE158550 是一个来自 NCBI GEO 的转录组测序数据集，标题为“BRD8 maintains glioblastoma by epigenetic reprogramming of the P53 network [RNA-seq]”，属于肿瘤与脑肿瘤研究方向。该数据集围绕 BRD8 通过 P53 网络表观遗传重编程维持胶质母细胞瘤这一主题，提供高通量测序的转录组分析数据，共包含 1 个文件，样例文件为 GSE158550_series_matrix.txt.gz。数据集由 Xueqin、Sun 提交，发布时间为 Sep 24 202，主题标签涉及高通量测序表达谱分析、GPL18573 平台与物种编号 9606，可用于了解该研究中的基因表达谱信息。

【数据集背景】

该数据集来源于 NCBI GEO，源站标题为“BRD8 maintains glioblastoma by epigenetic reprogramming of the P53 network [RNA-seq]”。从标题可以看出，其研究背景聚焦于胶质母细胞瘤中 BRD8 与 P53 网络之间的表观遗传调控关系。数据集属于肿瘤与脑肿瘤分类，主题标签包含“Expression profiling by high throughput sequencing”，说明其核心是通过高通量测序获取表达谱数据。源站描述为“Transcriptome analysis by high throughput sequencing”，即利用高通量测序进行转录组分析。作者信息记录为 Xueqin、Sun，发布时间为 Sep 24 202。

【数据内容】

该数据集提供高通量测序转录组分析数据，文件数量为 1，文件样例为 GSE158550_series_matrix.txt.gz。主题标签中包含 GPL18573 与 9606，分别对应数据集所关联的平台信息和物种编号。数据集标题中的“[RNA-seq]”表明这是该研究中的 RNA 测序部分。源站描述仅说明其为高通量测序转录组分析，未进一步提供样本数量、分组设计、基因数量或具体表达矩阵字段等细节。文件样例显示数据以 series matrix 形式组织，并采用 GZIP 压缩格式分发。

【采集与来源】

数据集的来源站为 ncbi.nlm.nih.gov，属于 NCBI GEO 数据库收录的数据。作者为 Xueqin、Sun，发布时间为 Sep 24 202。主题标签中的 GPL18573 提供了平台层面的标识，9606 为物种编号。源站描述仅概括为高通量测序转录组分析，未提供具体的测序平台型号、建库方法、测序读长、样本采集与处理流程等信息，这些内容源站未提供。

【适用场景】

该数据集适用于围绕胶质母细胞瘤中 BRD8 与 P53 网络表观遗传调控的转录组层面分析，例如查看高通量测序表达谱、了解该研究 RNA-seq 部分的数据组织方式。由于主题标签包含高通量测序表达谱分析，也可用于与表达谱相关的数据读取与初步核对工作。数据集分类为肿瘤与脑肿瘤，适合脑肿瘤转录组研究背景下的数据参考。具体可支持的统计比较、差异表达分析或通路分析范围，需以实际数据内容为准，源站未提供相关说明。

【使用方法】

使用时可先下载数据文件 GSE158550_series_matrix.txt.gz，按文件格式以 GZIP 压缩包方式读取。建议先在小样本上核对字段与编码，确认无误后再批量接入。由于文件为 series matrix 形式，读取后应检查其矩阵结构、样本标识与表达值编码方式，确保后续分析流程能够正确解析。源站未提供更详细的分析步骤或推荐工具。

【质量与限制】

该数据集文件数量为 1，数据规模与样本组成信息源站未提供。源站描述仅为“Transcriptome analysis by high throughput sequencing”，未给出质控指标、测序深度、重复数或批次信息。主题标签中的 GPL18573 与 9606 提供了平台与物种标识，但平台具体型号与注释信息源站未提供。使用时应以实际下载文件的内容为准，并在小样本核对阶段确认字段与编码的完整性。由于缺少样本设计与处理流程的详细说明，跨数据集比较或深入统计推断需谨慎。

【引用与许可】

作者信息为 Xueqin、Sun，发布时间为 Sep 24 202。数据集来源于 NCBI GEO，源站为 ncbi.nlm.nih.gov。源站未提供具体的引用格式、许可条款或使用限制说明，相关引用与许可信息源站未提供。