K27M突变核小体与PRC2和MLL1双重互作塑造癌症表观遗传景观（Cut&Run）

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE158447

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

尽管组蛋白编码基因中与癌症相关的突变发生率较低，但它们能显著重塑染色质模式并促进肿瘤发生。组蛋白H3第27位赖氨酸被甲硫氨酸取代（K27M）是高级别儿童胶质瘤的驱动突变，已知可消除Polycomb活性。我们应用单分子系统对单个核小体进行成像，并描绘与K27M表达相关的组合染色质模式。我们发现，K27M突变型核小体不仅隔离PRC2，还优先与MLL1结合，从而导致H3K4me3在全基因组范围内的重新分布。K27M介导的抑制性和激活性染色质标记失调维持了“双价”染色质状态，支持分化不良的细胞状态。本研究为K27M致癌组蛋白对多个核心表观遗传通路的广泛影响提供了证据，并强调了单分子工具在揭示癌症中染色质失调机制方面的应用。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。