GSE158244：CBX7 是抑制膀胱癌的肿瘤抑制因子

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源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE158244

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数据说明

多梳组蛋白（PcG）是表观遗传调控复合物，其失调与多种生物学过程相关，包括细胞身份维持、分化、增殖及癌症进展。PcG形成两种多蛋白复合物：多梳抑制复合物1（PRC1）和PRC2(1)。PRC2蛋白复合物主要由早期胚胎缺陷蛋白（EED）、Zeste抑制因子（SUZ12）和Zeste增强因子（EZH）组成，可催化组蛋白H3第27位赖氨酸三甲基化（H3K27me3），从而在染色质上留下转录抑制标记。这些修饰由经典PRC1识别和读取，PRC1由CBX（多梳）、PCGF（多梳组因子）、HPH（人同源多梳蛋白）及E3泛素连接酶蛋白（RING）组成，后者催化组蛋白H2A第119位赖氨酸单泛素化（H2AK119ub1）。H3K27me3标记被PRC1中CBX蛋白的染色质结构域识别并结合，进而通过RING蛋白使H2AK119泛素化。

PRC2与PRC1在染色质中的相互作用有助于染色质压缩和靶基因的转录沉默。人类中有五种chromobox蛋白，即CBX2、4、6、7和8。越来越多的证据支持CBX蛋白在肿瘤发生中的重要作用。值得注意的是，CBX蛋白在不同癌症类型的肿瘤发展中表现出相反的功能。例如，CBX7在卵巢癌和前列腺癌中过表达，暗示其在这些肿瘤类型中具有致癌作用。相反，CBX7作为肿瘤抑制因子发挥作用，CBX7的缺失与膀胱癌、乳腺癌、胰腺癌、胶质瘤和结肠癌恶性程度增加相关（3 4 5 6 7），但其肿瘤抑制机制尚不清楚。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。