GSE151155:Musashi1通过调控DNA复制、细胞周期和分裂基因网络促进胶质母细胞瘤发展
该数据集来自NCBI GEO,标题为Musashi1通过调控DNA复制、细胞周期和分裂基因网络促进胶质母细胞瘤发展。研究通过综合基因组分析鉴定出细胞周期/分裂和DNA复制基因网络,并确定这些过程为Msi1的核心功能,Msi1通过直接相互作用和间接机制调控该网络

基本信息
资源简介
GSE151155:Musashi1通过调控DNA复制、细胞周期和分裂基因网络促进胶质母细胞瘤发展
Musashi1 contributes to glioblastoma development via regulation of a network of DNA replication, cell cycle, and division genes
该数据集来自NCBI GEO,标题为Musashi1通过调控DNA复制、细胞周期和分裂基因网络促进胶质母细胞瘤发展。数据为高通量测序表达谱,包含1个文件GSE151155_series_matrix.txt.gz,平台GPL11154,物种9606。研究通过综合基因组分析鉴定出细胞周期/分裂和DNA复制基因网络,并确定这些过程为Msi1的核心功能,Msi1通过直接相互作用和间接机制调控该网络。数据可用于胶质母细胞瘤中Msi1调控机制及表达谱分析(来源 NCBI)。
【数据集背景】
源站首次发布:May 25 202。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):RNA结合蛋白(RBP)作为基因表达的主调控因子发挥作用。其表达水平和功能的改变常在肿瘤中观察到,近年来已鉴定出众多致癌RBP。Musashi1(Msi1)是一种RBP和干细胞标志基因,控制自我更新与增殖之间的平衡。在包括胶质母细胞瘤在内的多种肿瘤类型中观察到高Msi1水平,且常与患者不良预后相关。已知Msi1敲低会影响众多癌症表型并阻止不同肿瘤类型的生长。为剖析Msi1对胶质母细胞瘤发展的主要贡献,我们进行了全面的基因组分析。我们鉴定出一个细胞周期/分裂和DNA复制基因网络,并确立这些过程为其核心功能。Msi1通过两种机制控制该基因网络:直接相互作用和间接
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个,合计 0 B。
【主题与分类】
主题标签:GPL11154、9606。本站分类:肿瘤/脑肿瘤。
【获取与许可】
源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE151155
【使用注意】
· 源站最后修改于 Apr 20 202,引用时请注意版本时效。
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- OpenDataLab:
数据说明
RNA结合蛋白(RBPs)作为基因表达的主调控因子发挥作用。其表达水平和功能的改变常在肿瘤中观察到,近年来已鉴定出众多具有致癌性的RBPs。Musashi1(Msi1)是一种RBP及干细胞标志基因,调控自我更新与增殖之间的平衡。在包括胶质母细胞瘤在内的多种肿瘤类型中观察到Msi1高表达,且常与患者不良预后相关。已知敲低Msi1可影响众多癌症表型并抑制不同肿瘤类型的生长。为剖析Msi1对胶质母细胞瘤发展的主要贡献,我们进行了全面的基因组分析。我们鉴定了一个由细胞周期/分裂和DNA复制基因组成的网络,并确定这些过程为其核心功能。Msi1通过两种机制调控该基因网络:直接相互作用以及由转录因子E2F2和E2F8介导的间接调控。我们证实了Msi1对这些过程的影响,并确定Msi1敲除的胶质母细胞瘤细胞系对细胞周期和DNA复制抑制剂表现出增加的敏感性。
随着Msi1抑制剂的发现,联合用药策略(Msi1抑制剂+细胞周期/DNA复制抑制剂)可能成为治疗胶质母细胞瘤的可行途径。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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