IDH1突变骨髓CD45+细胞经AZA、BAY1436032及联合处理后的基因表达变化

该数据集来自NCBI GEO,收录了从IDH1突变患者骨髓中分离的人CD45+细胞在体外经去甲基化药物Azacitidine(AZA)、IDH1抑制剂BAY1436032(BAY)以及两者序贯和同时联合处理后的基因表达变化数据,采用高通量测序进行表达谱分析,共1个文件

geo
浏览 2
基因组回归GPL246769606
GSE146503: Gene expression changes induced by hypomethylating agent, Azacitidine (AZA); IDH1 inhibitor, BAY1436032 (BAY) and sequential and simultaneous combination of BAY and AZA in  in vitro treated human (CD45+) cells isolated from the  bone marrow of IDH1mut

基本信息

模态
基因组
任务类型
回归
创建/更新时间
2026-10-25

资源简介

IDH1突变骨髓CD45+细胞经AZA、BAY1436032及联合处理后的基因表达变化

Gene expression changes induced by hypomethylating agent, Azacitidine (AZA); IDH1 inhibitor, BAY1436032 (BAY) and sequential and simultaneous combination of BAY and AZA in in vitro treated human (CD45+) cells isolated from the bone marrow of IDH1mut

该数据集来自NCBI GEO,收录了从IDH1突变患者骨髓中分离的人CD45+细胞在体外经去甲基化药物Azacitidine(AZA)、IDH1抑制剂BAY1436032(BAY)以及两者序贯和同时联合处理后的基因表达变化数据,采用高通量测序进行表达谱分析,共1个文件。数据可用于研究IDH1抑制剂与去甲基化药物联合应用对白血病细胞转录组的影响,为探索提高IDH1抑制剂疗效的联合策略提供参考(来源 NCBI)。

【数据集背景】

源站首次发布:Mar 06 202。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):在胶质瘤、软骨肉瘤、甲状腺癌、淋巴瘤、黑色素瘤以及急性髓系白血病等多种肿瘤中均已发现IDH1和IDH2酶的突变。突变的IDH1/2产生代谢物2-羟基戊二酸(2HG),后者干扰基因表达的表观遗传调控,因而可能促进肿瘤发生。IDH1抑制剂的数据显示,30-40%的AML患者对单药治疗有应答,中位缓解持续时间为8个月,提示IDH1抑制剂应与其他药物联合以提高疗效。BAY 1436032(BAY)是一种口服泛突变型IDH1抑制剂,目前正在进行1期临床试验。5-阿扎胞苷(AZA)是一种去甲基化药物,可激活AML细胞中关键的表观遗传沉默通路,导致AML细胞增殖停滞。

【数据结构与技术规格】

文件数 1 个,合计 0 B。

【主题与分类】

主题标签:GPL24676、9606。本站分类:肿瘤/脑肿瘤。

【获取与许可】

源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE146503

【使用注意】

· 源站最后修改于 May 27 202,引用时请注意版本时效。

官方服务

专家保障全链路合规授权与标注交付

陕川双基地 × 超十家三甲医院直连

从合规授权、采集治理、专业标注到数据集交付,我们提供全链路闭环服务,让高质量临床数据即拿即用。

⚡️ 需要原始数据或标注支持?联系我们获取定制方案。

帮我联系

下载信息

注册下载

需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。

暂未开放

公开下载

无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。

免登录

有偿下载

公开数据集受托下载与技术交付服务。

提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)

暂未开放

当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。

使用方式

数据集获取

源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE146503

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

在胶质瘤、软骨肉瘤、甲状腺癌、淋巴瘤、黑色素瘤以及急性髓系白血病等多种肿瘤中,均已发现IDH1和IDH2酶的突变。突变的IDH1/2会产生代谢物2-羟基戊二酸(2HG),该代谢物干扰基因表达的表观遗传调控,因而可能促进肿瘤发生。IDH1抑制剂的数据显示,30-40%的AML患者对单药治疗有应答,中位缓解持续时间为8个月,提示IDH1抑制剂应与其他药物联合以提高疗效。BAY 1436032(BAY)是一种口服的泛突变型IDH1抑制剂,目前正在进行1期临床试验。5-阿扎胞苷(AZA)是一种低甲基化剂,可激活AML细胞中关键的表观遗传沉默通路,从而导致AML细胞增殖停滞。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。

数据缺失?

依托陕西、四川两大基地,我们与超过十家三甲医院建立直接合作关系,覆盖合规授权、采集治理、专业标注、数据交付的全流程,为AI医疗团队提供即拿即用的高质量临床数据。

⚡️ 需要数据支持或标注服务?立即联系我们获取专业方案。

获取专属数据定制方案