IDH1突变患者来源异种移植小鼠骨髓CD45+细胞中AZA、BAY及联合用药的基因表达变化
该数据集来自ncbi.nlm.nih.gov，包含IDH1突变患者来源异种移植小鼠模型骨髓中分选的人CD45+细胞，在低甲基化药物Azacitidine（AZA）、IDH1抑制剂BAY1436032（BAY）及两者联合处理后产生的基因表达变化数据
基本信息
资源简介
IDH1突变患者来源异种移植小鼠骨髓CD45+细胞中AZA、BAY及联合用药的基因表达变化
Gene expression changes induced by hypomethylating agent, Azacitidine (AZA) ; IDH1 inhibitor, BAY1436032 (BAY) and combination of BAY and AZA in sorted human (CD45+) cells from bone marrow of IDH1mut Patient derived Xenotransplantation mice model.
该数据集来自ncbi.nlm.nih.gov，包含IDH1突变患者来源异种移植小鼠模型骨髓中分选的人CD45+细胞，在低甲基化药物Azacitidine（AZA）、IDH1抑制剂BAY1436032（BAY）及两者联合处理后产生的基因表达变化数据。数据以表达谱芯片形式提供，共1个文件，主题标签涉及Expression profiling by array、GPL570和9606。该数据可用于研究IDH1抑制剂与低甲基化药物联合作用的转录组效应，以及筛选与药物响应相关的基因表达特征（来源 NCBI）。
【数据集背景】
源站首次发布：Nov 12 201。
【数据内容】
源站描述（机器翻译，仅供参考）：在胶质瘤、软骨肉瘤、甲状腺癌、淋巴瘤、黑色素瘤以及急性髓系白血病等多种肿瘤中，已发现IDH1和IDH2酶的突变。突变的IDH1/2会产生代谢物2-羟基戊二酸（2HG），后者干扰基因表达的表观遗传调控，因而可能促进肿瘤发生。IDH1抑制剂的数据显示，30-40%的AML患者对单药治疗有响应，中位缓解持续时间为8个月，提示IDH1抑制剂应与其他药物联合以提高疗效。BAY 1436032（BAY）是一种口服泛突变IDH1抑制剂，目前正在进行1期临床试验。5-阿扎胞苷（AZA）是一种低甲基化药物，可激活AML细胞中关键的表观遗传沉默通路，导致AML细胞增殖停滞。
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个，合计 0 B。
【主题与分类】
主题标签：Expression profiling by array、GPL570、9606。本站分类：肿瘤/脑肿瘤。
【获取与许可】
源站页面：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE122428
【使用注意】
· 源站最后修改于 Apr 09 202，引用时请注意版本时效。
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pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
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- OpenDataLab:
数据说明
IDH1和IDH2酶的突变已在多种肿瘤中被发现，如胶质瘤、软骨肉瘤、甲状腺癌、淋巴瘤、黑色素瘤以及急性髓系白血病。突变的IDH1/2会产生代谢物2-羟基戊二酸（2HG），该物质干扰基因表达的表观遗传调控，从而可能促进肿瘤发生。IDH1抑制剂的数据显示，30-40%的AML患者对单药治疗有反应，中位缓解持续时间为8个月，提示IDH1抑制剂应与其他药物联合使用以提高疗效。BAY 1436032（BAY）是一种口服的泛突变IDH1抑制剂，目前正在进行1期临床试验。5-阿扎胞苷（AZA）是一种低甲基化剂，能够激活AML细胞中关键的表观遗传沉默通路，导致AML细胞增殖停滞。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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