GSE120793：GBM样V-ATPase特征通过大型癌小体指导细胞间肿瘤信号传导与重编程

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE120793

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数据说明

胶质母细胞瘤（GBM）是成人中最具侵袭性和最常见的恶性脑肿瘤。GBM的特征是瘤内高度异质性和存在癌症干细胞龛。液泡ATP酶（V-ATPase）是一种多亚基质子泵，在真核细胞的多种过程中发挥作用。V-ATP酶活性改变与多种人类疾病相关，在癌症中可能由于细胞器（如内体和溶酶体）的酸化而发挥相关作用。我们在GBM来源的神经球（NS）中发现了V-ATP酶V1G1亚基的过表达，NS是一种富含癌症干细胞的细胞亚群。有趣的是，GBM NS分泌不同类型的囊泡，包括大肿瘤体（LO），从而影响其微环境。在此，我们通过微阵列评估了与LO或空培养基（模拟）共培养的非球形成胶质瘤细胞（n=2对）的转录组，以识别与LO诱导的重编程能力相关的通路。

基因集富集分析（GSEA）显示，添加LO的培养物激活了若干癌症相关通路，包括参与胶质瘤V-ATPase相关信号传导的通路（Notch、mTOR和溶酶体运输），以及细胞增殖和细胞转录程序。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。