GSE104592：抑癌因子Brat通过抑制转录因子Deadpan和Zelda控制神经元谱系

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE104592

标准获取流程：

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   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
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     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

TRIM-NHL蛋白Brain tumor（Brat）在果蝇大脑中作为抑癌因子发挥作用，但其抑制肿瘤形成的机制尚未完全阐明。在本研究中，我们将温度控制的brat RNAi与转录组分析相结合，以鉴定果蝇神经母细胞中brat的直接靶标。除了已知靶标Deadpan（Dpn）外，我们的实验还鉴定出转录因子Zelda（Zld）是brat的关键靶标。我们的数据表明，Zld在神经母细胞中表达，并且是瞬时扩增的中间神经祖细胞中Dpn重新表达所必需的。神经母细胞分裂后，Brat富集于其中一个子细胞中，其NHL结构域直接结合dpn和zld mRNA 3‘UTR中的特定基序，介导其降解。在brat突变体中，Dpn和Zld均持续表达，但抑制任一转录因子均可阻止肿瘤发生。我们的遗传学和生化数据表明，抑制Dpn所需的Brat水平高于抑制Zld，并提示一种模型：对不同因子的逐步转录后抑制确保了干细胞谱系中命运的顺序产生。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。