胶质瘤干细胞原位纵向采样揭示Chr7获得与Chr10缺失在原发性肿瘤形成和复发中的重复事件（SNP）

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE101110

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

在本研究中，我们通过从初次诊断时以及患者去世后肿瘤复发时大脑远端多个肿瘤区域生成多克隆和单克隆胶质瘤干细胞系，为GBM病例构建了一个广泛的数据集。我们的分析揭示了复发肿瘤中新克隆的组织广泛扩展，以及7号染色体增益和10号染色体丢失是原发性和复发性疾病中反复出现的基因组事件。此外，尽管肿瘤之间存在其他高度异质性和分歧的基因组改变，7号染色体增益和10号染色体丢失在原发性和复发性肿瘤中产生了相似的mRNA表达谱变化。我们确定了ETV1和CDK6作为可能的候选基因，以及NFKB（复合体）、IL1B、IL6、Akt和VEGF作为潜在的信号调节因子，可能是chr7增益和chr10丢失的潜在中心下游效应器。最后，7号染色体增益和10号染色体丢失后转录组变化引起的差异与大规模患者肿瘤数据集中GBM样本相较于正常大脑通常观察到的差异一致。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。