123例IDH WT胶质母细胞瘤的芯片基因分型
GBM是最常见且最具侵袭性的弥漫性胶质瘤，以染色体拷贝数改变、CDKN2A纯合缺失和EGFR扩增等基因组不稳定为特征。该数据可用于识别IDH WT胶质母细胞瘤中的复发性基因组异常，支持染色体不稳定与肿瘤发生关系的研究（来源 omicsdi.org）
基本信息
资源简介
123例IDH WT胶质母细胞瘤的芯片基因分型
该数据集来自omicsdi.org，收录123例IDH野生型胶质母细胞瘤（GBM）的SNP array基因分型数据，采用Illumina 850K CytoSNP芯片分析。GBM是最常见且最具侵袭性的弥漫性胶质瘤，以染色体拷贝数改变、CDKN2A纯合缺失和EGFR扩增等基因组不稳定为特征。该数据可用于识别IDH WT胶质母细胞瘤中的复发性基因组异常，支持染色体不稳定与肿瘤发生关系的研究（来源 omicsdi.org）。
【数据内容】
源站描述（机器翻译，仅供参考）：胶质母细胞瘤（GBM）是弥漫性胶质瘤中最常见且最具侵袭性的形式。预后极差，最大安全切除联合放化疗后中位总生存期为15个月。GBM是遗传上最不稳定的癌症之一，其特征是大量染色体（chr）拷贝数改变（CNA），如7号染色体获得、9p缺失和10号染色体丢失，以及CDKN2A纯合缺失（chr 9p21）和EGFR扩增（chr 7p11）。染色体不稳定（CIN）可能是GBM发生的原因或结果。在高分级弥漫性胶质瘤（HGG）中，CIN可能启动肿瘤发生。为识别IDH WT胶质母细胞瘤中的复发性基因组异常，对123例IDH WT GBM病例的SNP芯片（Illumina 850K CytoSNP）进行了分析。
【主题与分类】
主题标签：Transcriptomics。本站分类：肿瘤/脑肿瘤。
【获取与许可】
源站页面：https://omicsdi.org/dataset/biostudies-arrayexpress/E-MTAB-6371
下载信息
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源站：https://omicsdi.org/dataset/biostudies-arrayexpress/E-MTAB-6371
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- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
胶质母细胞瘤（GBM）是弥漫性胶质瘤中最常见且最具侵袭性的类型。其预后极差，在接受最大范围安全切除及放化疗后，中位总生存期仅为15个月。GBM是遗传学上最不稳定的癌症之一，其特征为大量染色体（chr）拷贝数改变（CNA），如7号染色体获得、9p缺失和10号染色体缺失，同时伴有CDKN2A纯合性缺失（9p21）和EGFR扩增（7p11）。染色体不稳定性（CIN）可能是GBM发生的原因或结果。在高分级弥漫性胶质瘤（HGG）中，CIN可能启动肿瘤发生。为识别IDH野生型胶质母细胞瘤中的复发性基因组异常，对123例IDH野生型GBM病例进行了SNP阵列（Illumina 850K CytoSNP）分析。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
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