原发性多形性胶质母细胞瘤手术标本的全基因组microRNA表达分析

数据包含82例原发性多形性胶质母细胞瘤(GBM)手术标本以及5例来自动静脉畸形(AVM)周围区域的正常脑组织对照,采用全基因组microRNA表达谱分析

omicsdi
浏览 4
基因组预测Transcriptomics
Genome-wide analysis of microRNA expression in surgical specimens of primary glioblastoma multiform

基本信息

模态
基因组
任务类型
预测
创建/更新时间
2026-10-08

资源简介

原发性多形性胶质母细胞瘤手术标本的全基因组microRNA表达分析

该数据集围绕原发性多形性胶质母细胞瘤(GBM)的microRNA表达展开,旨在通过全基因组microRNA表达谱分析,识别与患者临床结局预测相关的miRNA特征。数据来源于82例原发性多形性胶质母细胞瘤手术标本,并纳入5例来自动静脉畸形(AVM)周围区域的正常脑组织作为对照。研究关注microRNA在预测癌症患者生存方面的潜力,属于肿瘤/脑肿瘤领域,主题标签为Transcriptomics,来源站为omicsdi.org。整体而言,该数据集为探索GBM中microRNA表达模式及其与预后关系提供了转录组学层面的资源。

【数据集背景】

microRNA在预测癌症患者生存方面具有较大潜力。该数据集所对应的研究采用全基因组microRNA表达谱分析,目标是识别可用于预测原发性GBM患者临床结局的miRNA特征。原发性多形性胶质母细胞瘤是脑肿瘤中的一种重要类型,围绕其手术标本开展microRNA表达研究,有助于从转录组层面理解该肿瘤的分子特征。该数据集被归类于肿瘤/脑肿瘤方向,主题标签为Transcriptomics,来源站为omicsdi.org。

【数据内容】

数据包含82例原发性多形性胶质母细胞瘤手术标本,以及5例来自动静脉畸形(AVM)周围区域的正常脑组织对照。研究从这些样本中获取总RNA,并开展全基因组microRNA表达谱分析。数据内容的核心在于microRNA表达信息,其设计目的是通过比较肿瘤标本与正常脑组织对照,识别与原发性GBM临床结局预测相关的miRNA特征。除上述样本数量、样本类型和表达谱分析类型外,源站未提供更多关于数据文件格式、字段结构或具体表达值的信息。

【采集与来源】

样本来源包括82例原发性多形性胶质母细胞瘤手术标本,以及5例来自动静脉畸形(AVM)周围区域的正常脑组织。总RNA即从上述标本中获取。该数据集的来源站为omicsdi.org。关于样本采集的具体时间、地点、机构、伦理审批信息以及RNA提取和表达谱检测的具体实验平台,源站未提供。

【适用场景】

该数据集适用于与原发性多形性胶质母细胞瘤相关的microRNA表达研究,尤其是围绕癌症患者生存预测、临床结局相关miRNA特征识别等方向的分析。由于包含肿瘤手术标本与正常脑组织对照,也可用于比较GBM与对照脑组织之间的microRNA表达差异。主题标签为Transcriptomics,表明其适用于转录组学层面的探索。其他具体应用场景,源站未提供。

【使用方法】

源站未提供该数据集的具体使用方法,包括数据下载方式、预处理流程、分析工具、统计方法或代码示例等。使用者如需使用,应依据来源站omicsdi.org提供的相关信息进一步获取说明。

【质量与限制】

源站未提供关于数据质量、样本纳入排除标准、批次效应、技术重复、数据完整性或验证结果等信息。该数据集包含82例原发性GBM手术标本和5例AVM周围正常脑组织对照,对照样本数量相对较少;除此以外,源站未提供其他质量与限制说明。

【引用与许可】

源站未提供该数据集的引用方式、许可协议或使用限制等信息。

官方服务

专家保障全链路合规授权与标注交付

陕川双基地 × 超十家三甲医院直连

从合规授权、采集治理、专业标注到数据集交付,我们提供全链路闭环服务,让高质量临床数据即拿即用。

⚡️ 需要原始数据或标注支持?联系我们获取定制方案。

帮我联系

下载信息

注册下载

需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。

暂未开放

公开下载

无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。

免登录

当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。

免费样本无法满足模型训练要求?千方提供经三甲医院脱敏、带病理回证与专家标注的商业级专病数据集。

使用方式

数据集获取

源站:https://omicsdi.org/dataset/biostudies-arrayexpress/E-GEOD-25631

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

MicroRNA在预测癌症患者生存方面具有巨大潜力。我们采用全基因组microRNA表达谱分析,以识别用于预测原发性GBM患者临床结局的miRNA特征。从82例原发性多形性胶质母细胞瘤手术标本及5例作为对照的动静脉畸形(AVM)周围正常脑组织中提取总RNA。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。

需要用于商业化训练或医疗器械注册(NMPA/FDA)?

公开数据往往缺乏完整的病理回证与专家标注。千方医数集依托陕川双基地与超十家三甲医院直连,提供完全合规、去标识化、支持注册级质控的专病数据集交易服务。