脑脊液循环肿瘤DNA甲基化全基因组分析:胶质母细胞瘤溶瘤病毒临床试验 [mRNA-Seq]
该数据集来自 omicsdi.org,属于肿瘤 / 脑肿瘤分类,主题标签为 Genomics。数据内容为胶质母细胞瘤溶瘤病毒临床试验中脑脊液循环肿瘤DNA甲基化谱的全基因组分析,并包含 mRNA-Seq 数据
![Genome-wide analysis of circulating tumor DNA methylation profiles in cerebrospinal fluid: a clinical trial of oncolytic virus for glioblastoma [mRNA-Seq]](/medical-api/medicalDataset/datasetCover/116777.jpg)
基本信息
资源简介
脑脊液循环肿瘤DNA甲基化全基因组分析:胶质母细胞瘤溶瘤病毒临床试验 [mRNA-Seq]
该数据集英文名为 Genome-wide analysis of circulating tumor DNA methylation profiles in cerebrospinal fluid: a clinical trial of oncolytic virus for glioblastoma [mRNA-Seq],来源于 omicsdi.org,在分类上属于肿瘤 / 脑肿瘤,主题标签为 Genomics。从名称和来源信息来看,该数据集围绕胶质母细胞瘤的溶瘤病毒临床试验展开,聚焦脑脊液中循环肿瘤 DNA 甲基化谱的全基因组分析,并包含 mRNA-Seq 数据。其核心价值在于将脑脊液这一中枢神经系统邻近体液中的循环肿瘤 DNA 甲基化信息,与溶瘤病毒治疗胶质母细胞瘤的临床研究背景相结合,为探索脑肿瘤的分子特征、治疗响应及相关生物标志物提供组学数据基础。整体而言,该数据集属于肿瘤基因组学与脑肿瘤研究交叉方向的数据资源,适合关注液体活检、甲基化组和转录组的研究者参考使用。
【数据集背景】
该数据集所对应的研究背景为胶质母细胞瘤的溶瘤病毒临床试验。胶质母细胞瘤属于脑肿瘤范畴,而该数据集的主题标签为 Genomics,说明其关注点落在基因组学层面的分析。数据集名称中同时出现 circulating tumor DNA methylation profiles in cerebrospinal fluid 与 oncolytic virus for glioblastoma,表明其研究场景是将脑脊液循环肿瘤 DNA 的甲基化谱分析置于溶瘤病毒治疗胶质母细胞瘤的临床试验框架之下。该数据集来源于 omicsdi.org,本站分类为肿瘤 / 脑肿瘤。除上述信息外,关于该临床试验的具体分期、受试者规模、治疗方案细节等,源站未提供。
【数据内容】
该数据集的核心内容为脑脊液循环肿瘤 DNA 甲基化谱的全基因组分析,并包含 mRNA-Seq 数据。从名称中的 Genome-wide analysis 可以理解,其甲基化分析覆盖全基因组范围;从 mRNA-Seq 标注可以理解,数据中还包括转录组测序相关内容。主题标签为 Genomics,进一步表明数据属于基因组学范畴。该数据集被归入肿瘤 / 脑肿瘤分类,说明其数据内容与肿瘤尤其是脑肿瘤研究直接相关。关于样本数量、测序深度、甲基化位点数量、mRNA-Seq 的具体读长或表达基因数目等具体指标,源站未提供。
【采集与来源】
该数据集来源于 omicsdi.org。其英文名称显示,样本类型涉及脑脊液中的循环肿瘤 DNA,研究背景为胶质母细胞瘤溶瘤病毒临床试验。因此,数据的采集场景与脑脊液液体活检相关,并置于临床试验语境中。关于采集地点、采集时间、机构名称、伦理审批信息、样本处理流程、测序平台等具体采集与来源细节,源站未提供。
【适用场景】
该数据集适用于肿瘤 / 脑肿瘤相关研究,尤其是胶质母细胞瘤的分子特征探索。由于涉及脑脊液循环肿瘤 DNA 甲基化谱的全基因组分析,可用于关注液体活检、DNA 甲基化、脑脊液生物标志物等方向的研究。同时,数据集包含 mRNA-Seq 数据,也可供转录组相关分析参考。其与溶瘤病毒临床试验相关联,因此适合在溶瘤病毒治疗胶质母细胞瘤的研究背景下,探索甲基化谱与转录组数据的潜在用途。关于具体的分析场景、可验证的科学假设或临床转化方向,源站未提供。
【使用方法】
该数据集可通过 omicsdi.org 获取。使用时,可依据其英文名称和主题标签定位到肿瘤 / 脑肿瘤及 Genomics 相关数据。由于数据内容涉及全基因组甲基化谱和 mRNA-Seq,使用者可根据自身研究目的,将甲基化数据与转录组数据结合分析。关于具体的数据格式、下载方式、预处理步骤、分析工具或流程,源站未提供。
【质量与限制】
该数据集来源于 omicsdi.org,本站分类为肿瘤 / 脑肿瘤,主题标签为 Genomics。其名称表明数据涉及胶质母细胞瘤溶瘤病毒临床试验中的脑脊液循环肿瘤 DNA 甲基化谱全基因组分析及 mRNA-Seq。关于数据质量指标、缺失值情况、批次效应、样本量限制、临床信息完整度等,源站未提供。使用者应结合源站信息自行评估数据适用性。
【引用与许可】
该数据集来源于 omicsdi.org。关于引用方式、许可协议、使用条款、数据共享政策等,源站未提供。
下载信息
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使用方式
数据集获取
源站:https://omicsdi.org/dataset/project/PRJNA846682
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- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
Genome-wide analysis of circulating tumor DNA methylation profiles in cerebrospinal fluid: a clinical trial of oncolytic virus for glioblastoma [mRNA-Seq]
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