儿童脑肿瘤基因表达谱

该数据集来自 omicsdi.org,收录儿童脑肿瘤的基因表达谱数据,覆盖 57 例儿童脑肿瘤样本及 8 例成人脑和 8 例胎儿脑对照,肿瘤类型包括毛细胞型星形细胞瘤、弥漫性星形细胞瘤、间变性星形细胞瘤、胶质母细胞瘤、室管膜瘤、髓母细胞瘤、非典型畸胎样/横纹肌样瘤和脉络丛乳头状瘤

omicsdi
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基因组分类Transcriptomics
Gene expression profiles for paediatric brain tumours

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-22

资源简介

儿童脑肿瘤基因表达谱

该数据集为儿童脑肿瘤的基因表达谱数据,来源于 omicsdi.org,归类于肿瘤 / 脑肿瘤方向,主题标签为转录组学(Transcriptomics)。研究对一组病理类型分布广泛的 57 例儿童脑肿瘤进行了基因表达谱筛查,并将肿瘤样本的基因表达与正常成人脑组织进行比较,以了解其分子特征。队列构成包括 15 例毛细胞型星形细胞瘤、3 例弥漫性星形细胞瘤、2 例间变性星形细胞瘤、5 例胶质母细胞瘤、14 例室管膜瘤、9 例髓母细胞瘤、5 例非典型畸胎样/横纹肌样瘤、4 例脉络丛乳头状瘤,并设置 8 例成人脑与 8 例胎儿脑作为对照。数据覆盖多种儿童脑肿瘤亚型,适合用于转录组层面的分子谱比较研究。

【数据集背景】

儿童脑肿瘤在病理类型上具有高度异质性,不同亚型在发生部位、组织学表现和分子特征上差异明显。该研究以识别儿童脑肿瘤的基因表达谱为目标,通过筛查覆盖广泛病理类型的儿童脑肿瘤队列,并将肿瘤组织与正常成人脑组织进行基因表达比较,以理解这些肿瘤的分子谱特征。研究同时纳入成人脑与胎儿脑作为对照,为解释肿瘤样本的表达特征提供参照背景。数据集所属分类为肿瘤 / 脑肿瘤,主题方向为转录组学。

【数据内容】

数据集收录儿童脑肿瘤的基因表达谱数据。研究队列共包含 57 例儿童脑肿瘤样本,具体构成如下:毛细胞型星形细胞瘤 15 例、弥漫性星形细胞瘤 3 例、间变性星形细胞瘤 2 例、胶质母细胞瘤 5 例、室管膜瘤 14 例、髓母细胞瘤 9 例、非典型畸胎样/横纹肌样瘤 5 例、脉络丛乳头状瘤 4 例。对照样本包括 8 例成人脑和 8 例胎儿脑。上述样本共同构成用于基因表达谱分析与比较的数据集合,覆盖了儿童脑肿瘤中多种代表性病理类型。

【采集与来源】

该数据集来源于 omicsdi.org。研究设计为对儿童脑肿瘤队列进行基因表达谱筛查,并将肿瘤样本的基因表达与正常成人脑进行比较;胎儿脑样本作为另一类对照纳入分析。源站描述未提供样本采集地点、采集时间、伦理审批信息以及具体的表达检测平台与方法细节。

【适用场景】

基于其队列构成与转录组主题,该数据集可用于儿童脑肿瘤不同病理类型之间基因表达谱的比较分析,也可用于肿瘤样本与成人脑、胎儿脑对照之间的表达特征对比,以探索各类儿童脑肿瘤的分子谱特点。数据覆盖毛细胞型星形细胞瘤、弥漫性星形细胞瘤、间变性星形细胞瘤、胶质母细胞瘤、室管膜瘤、髓母细胞瘤、非典型畸胎样/横纹肌样瘤和脉络丛乳头状瘤等多种类型,适合开展跨亚型的转录组层面描述性研究与分子特征梳理。

【使用方法】

源站未提供。

【质量与限制】

源站未提供。需注意的是,该队列中部分肿瘤类型的样本量较小,例如弥漫性星形细胞瘤 2 例、间变性星形细胞瘤 2 例,相关亚型的表达特征分析可能受到样本规模限制;对照样本为成人脑与胎儿脑,与儿童脑肿瘤样本在发育阶段和组织背景上存在差异。其余质量相关信息源站未提供。

【引用与许可】

源站未提供。

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使用方式

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源站:https://omicsdi.org/dataset/biostudies-arrayexpress/E-GEOD-42656

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

在本研究中,我们筛选了57例儿童脑肿瘤队列,涵盖多种病理类型,以识别基因表达谱。我们分析了儿童脑肿瘤与正常成人脑组织相比的基因表达,以了解其分子特征。我们的队列包括15例毛细胞型星形细胞瘤、3例弥漫性星形细胞瘤、2例间变性星形细胞瘤、5例胶质母细胞瘤、14例室管膜瘤、9例髓母细胞瘤、5例非典型畸胎样/横纹肌样瘤、4例脉络丛乳头状瘤、8例成人脑对照和8例胎儿脑对照。

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