儿童脑肿瘤基因表达:髓母细胞瘤与室管膜瘤

该数据集来自 ebi.ac.uk,主题为儿童脑肿瘤(髓母细胞瘤与室管膜瘤)的基因表达转录组表达谱,采用微阵列(transcription profiling by array)技术,物种为 Homo sapiens

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基因组分类transcription profiling by arrayHomo sapiens
Gene expression of pediatric brain tumors- medulloblastoma and ependymoma

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-24

资源简介

儿童脑肿瘤基因表达:髓母细胞瘤与室管膜瘤

该数据集英文名为 Gene expression of pediatric brain tumors- medulloblastoma and ependymoma,来自 ebi.ac.uk,本站归类为肿瘤 / 脑肿瘤。其主题为儿童脑肿瘤(髓母细胞瘤与室管膜瘤)的基因表达转录组表达谱,采用微阵列(transcription profiling by array)技术,研究物种为 Homo sapiens。源站描述指出,该研究旨在比较不同恶性程度的儿童脑肿瘤中的基因表达水平。数据集围绕儿童脑肿瘤的转录组表达特征展开,可用于了解髓母细胞瘤与室管膜瘤在基因表达层面的差异,并为相关肿瘤恶性程度的研究提供表达谱数据基础。

【数据集背景】

该数据集聚焦儿童脑肿瘤,具体涉及髓母细胞瘤与室管膜瘤两类肿瘤。源站描述说明,研究的目的是比较不同恶性程度的儿童脑肿瘤中的基因表达水平。围绕这一目的,数据集以基因表达转录组表达谱为核心内容,采用微阵列技术开展转录 profiling。主题标签包括 transcription profiling by array 与 Homo sapiens,表明数据来自人类样本的微阵列转录表达检测。该数据集在本站归入肿瘤 / 脑肿瘤分类,来源站为 ebi.ac.uk。

【数据内容】

数据集的主题为儿童脑肿瘤(髓母细胞瘤与室管膜瘤)的基因表达转录组表达谱。其技术类型为微阵列(transcription profiling by array),物种为 Homo sapiens。数据集英文名明确指向儿童脑肿瘤中的髓母细胞瘤与室管膜瘤。关于样本数量、具体基因数量、表达矩阵结构、分组设计、临床信息字段等细节,源站未提供。

【采集与来源】

该数据集来源站为 ebi.ac.uk。主题标签显示其采用 transcription profiling by array 技术,物种为 Homo sapiens。源站描述表明研究比较不同恶性程度的儿童脑肿瘤的基因表达水平。关于样本采集地点、采集时间、伦理审批信息、具体实验平台型号、数据处理流程等,源站未提供。

【适用场景】

基于其主题与技术类型,该数据集适用于儿童脑肿瘤(髓母细胞瘤与室管膜瘤)基因表达转录组表达谱相关的研究场景,例如比较不同恶性程度肿瘤之间的基因表达水平。其微阵列转录表达谱特征可用于转录层面的表达模式分析。关于具体的分析任务类型、标志物筛选、分类模型构建等细化应用,源站未提供。

【使用方法】

该数据集为微阵列转录表达谱数据,主题标签为 transcription profiling by array,物种为 Homo sapiens。关于数据下载方式、文件格式、预处理步骤、归一化方法、分析工具与参数设置等,源站未提供。

【质量与限制】

关于该数据集的质量评估信息、样本量、数据完整性、批次效应、平台参数、验证情况等,源站未提供。使用时需注意其主题范围限定于儿童脑肿瘤中的髓母细胞瘤与室管膜瘤,且为微阵列转录表达谱;其他质量与限制细节源站未提供。

【引用与许可】

关于该数据集的引用方式、许可协议、使用条款与署名要求等,源站未提供。

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使用方式

数据集获取

源站:https://ebi.ac.uk/biostudies/studies/E-MTAB-14259

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
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    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

Renata Gruszka (2024). Gene expression of pediatric brain tumors- medulloblastoma and ependymoma [Dataset]. https://www.ebi.ac.uk/biostudies/studies/E-MTAB-14259

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