G-SAM：接受标准治疗的胶质母细胞瘤转录演化
G-SAM 数据集收录了配对的胶质母细胞瘤原发与复发 RNA-seq 样本，多数样本可配对，并与一项更早的 DNA 测序研究相匹配
基本信息
资源简介
G-SAM：接受标准治疗的胶质母细胞瘤转录演化
G-SAM（Transcriptional Evolution of Glioblastomas Treated With Standard of Care）是一个聚焦胶质母细胞瘤转录组演化的数据集，收录了配对的胶质母细胞瘤原发与复发 RNA-seq 样本，其中多数样本可构成原发—复发配对，并且这些样本还能与一项更早的 DNA 测序研究相匹配。该数据集归属于肿瘤 / 脑肿瘤分类，主题标签为 Genomics，来源于 omicsdi.org。其核心价值在于从转录层面刻画接受标准治疗（Standard of Care）后胶质母细胞瘤的演化特征，为研究者提供可配对、可跨组学关联的样本资源。
【数据集背景】
胶质母细胞瘤是中枢神经系统常见的高侵袭性肿瘤，标准治疗后的复发与治疗抵抗是临床与基础研究关注的重点。G-SAM 以“接受标准治疗的胶质母细胞瘤的转录演化”为主题，围绕原发与复发阶段的转录组变化组织样本，并通过与更早的 DNA 测序研究相匹配，使转录层面的观察能够与既有基因组研究相互参照。该数据集所属分类为肿瘤 / 脑肿瘤，主题标签为 Genomics，体现了其在肿瘤基因组学与转录组学交叉方向上的定位。
【数据内容】
数据集的主体是胶质母细胞瘤的 RNA-seq 样本，包含原发与复发两类样本，且多数样本以配对形式存在，即同一病例的原发样本与复发样本可相互对应。除配对关系外，这些样本还与一项更早的 DNA 测序研究相匹配，从而在样本层面形成 RNA-seq 与 DNA 测序数据的对应关系。数据集英文名称中的“Transcriptional Evolution”点明了其内容侧重：通过原发与复发样本的转录组对比，反映治疗过程中肿瘤转录状态的变化。关于样本的具体数量、测序平台、读长、表达定量矩阵等细节，源站未提供。
【采集与来源】
该数据集来源于 omicsdi.org，并在本站归入肿瘤 / 脑肿瘤分类。源站描述表明，其样本为“多数可配对的胶质母细胞瘤原发与复发 RNA-seq 样本对”，并“与一项更早的 DNA 测序研究相匹配”。关于样本采集机构、采集时间、伦理审批信息、患者人群特征及具体处理流程，源站未提供。
【适用场景】
基于其配对设计与跨组学匹配特征，该数据集适用于研究胶质母细胞瘤在原发与复发阶段的转录组差异，探索标准治疗后肿瘤转录状态的演化；也适用于将 RNA-seq 层面的发现与更早的 DNA 测序研究结果进行对照分析，考察转录变化与基因组特征之间的对应关系。此外，对于关注配对样本分析方法的研究，该数据集可作为方法验证或比较的资源。关于具体的分析任务类型与已验证的应用案例，源站未提供。
【使用方法】
使用该数据集时，可依据原发—复发配对关系组织样本，进行配对比较分析；并可利用其与更早 DNA 测序研究的匹配关系，开展跨组学的样本级关联。关于数据下载方式、文件格式、访问入口、预处理流程与推荐分析工具，源站未提供。
【质量与限制】
源站描述强调“多数”样本可配对，说明并非所有样本均具备完整的原发—复发配对关系，使用时需注意配对样本的筛选。数据集与更早 DNA 测序研究的匹配关系为跨组学分析提供了基础，但匹配的具体覆盖程度源站未提供。关于样本量、测序深度、数据完整性评估、批次效应及质控指标等信息，源站未提供。
【引用与许可】
关于该数据集的引用方式、文献出处、许可协议与使用条款，源站未提供。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://omicsdi.org/dataset/ega/EGAS00001005436
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
Collection of mostly matching primary and recurrent glioblastoma RNA-seq sample pairs, also matching with an earlier DNA sequencing study
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
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