原发与复发胶质母细胞瘤患者DNA修复及细胞周期基因表达数据集
该数据集来自omicsdi.org，收录一组配对胶质母细胞瘤（GBM）患者样本中154个DNA修复及细胞周期基因的mRNA直接计数结果，采用Nanostring nCounter技术检测
基本信息
资源简介
原发与复发胶质母细胞瘤患者DNA修复及细胞周期基因表达数据集
该数据集聚焦于胶质母细胞瘤（GBM）患者样本中DNA修复与细胞周期相关基因的表达情况，英文名称为“Expression of DNA repair and cell cycle genes in a cohort of primary and recurrent glioblastoma multiforme patients”。数据集收录了一组配对GBM患者样本中154个DNA修复及细胞周期基因的mRNA直接计数结果，检测采用Nanostring nCounter技术完成。从分类上看，该数据集归属于肿瘤领域下的脑肿瘤方向，主题标签为转录组学（Transcriptomics），来源站为omicsdi.org。整体而言，该数据集为研究胶质母细胞瘤在原发与复发状态下DNA修复通路和细胞周期相关基因的转录表达特征提供了直接的计数型数据基础，适合用于转录层面的基因表达比较分析。
【数据集背景】
胶质母细胞瘤是脑肿瘤中备受关注的研究对象，其原发与复发状态之间的分子差异是理解疾病进展的重要切入点。DNA修复与细胞周期是影响肿瘤细胞增殖与治疗反应的关键生物学过程，针对这两个过程相关基因的表达进行系统测量，有助于刻画肿瘤样本在转录水平上的特征。该数据集正是围绕一组配对胶质母细胞瘤患者样本，对DNA修复和细胞周期相关基因的mRNA进行直接计数，从而为相关研究提供数据支撑。其主题归属为转录组学，分类上属于肿瘤/脑肿瘤方向。
【数据内容】
数据集的核心内容是154个DNA修复及细胞周期基因的mRNA直接计数结果，覆盖一组配对的GBM患者样本。所谓配对，意味着样本来自原发与复发相对应的患者个体，便于在同一患者背景下比较不同状态下的基因表达。检测对象明确限定为DNA修复与细胞周期这两类基因，测量结果为mRNA的直接计数，而非间接推断的表达量。数据集的英文名称也直接体现了其研究对象与范围，即原发与复发胶质母细胞瘤患者队列中DNA修复和细胞周期基因的表达。
【采集与来源】
该数据集来源于omicsdi.org。根据源站描述，数据通过nCounter技术（Nanostring）获得，属于对目标基因mRNA进行直接计数的检测方式。数据集收录的是一组配对GBM患者样本的检测结果，样本类型与患者队列信息与数据集名称所述一致。除上述来源与技术信息外，源站未提供更详细的采集时间、采集地点或样本处理流程等信息。
【适用场景】
基于其内容特征，该数据集适用于转录组学范畴内针对胶质母细胞瘤的基因表达研究，尤其是围绕DNA修复与细胞周期相关基因的表达比较分析。由于样本为配对的原发与复发GBM患者，数据可用于考察同一患者在原发与复发状态下这154个基因的mRNA计数差异。此外，采用nCounter技术获得的直接计数结果，适合用于目标基因 panel 层面的表达谱分析与验证性研究。具体应用方向应结合研究设计确定，源站未提供更多限定性说明。
【使用方法】
使用该数据集时，应以mRNA直接计数作为分析的基本单位，围绕154个DNA修复及细胞周期基因展开。由于样本具有配对特征，分析中宜考虑原发与复发样本之间的对应关系。数据集主题标签为转录组学，使用时可结合转录组学的通用分析思路组织数据。源站未提供具体的数据格式、文件组织方式或分析流程说明，实际使用需参照数据文件本身的结构。
【质量与限制】
该数据集的检测目标限定为154个DNA修复及细胞周期基因，属于靶向基因 panel 层面的表达数据，并不覆盖全转录组。样本为配对GBM患者队列，其样本量、患者临床信息及质控指标等细节源站未提供。数据采用nCounter技术进行mRNA直接计数，相关技术性能与数据质量评估信息源站未提供。使用时应充分注意其基因覆盖范围有限这一固有特点。
【引用与许可】
源站未提供该数据集的引用方式与许可信息。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://omicsdi.org/dataset/biostudies-arrayexpress/E-MTAB-6425
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
使用nCounter技术（Nanostring）对一组配对GBM患者的154个DNA修复和细胞周期基因进行直接mRNA计数
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
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