成人原发性胶质母细胞瘤表达数据

数据集获取

源站：https://omicsdi.org/dataset/biostudies-arrayexpress/E-GEOD-53733

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

基因表达谱分析显示，在长期生存者中，一种独特的（前神经样）表达特征呈现过度表达，且与IDH1/2突变相关。然而，在IDH1/2野生型患者中，长期生存者的肿瘤并未显示出独特的基因表达谱，且涵盖了前神经型、经典型和间质型胶质母细胞瘤亚型。我们对德国胶质瘤网络中70例胶质母细胞瘤患者的原发肿瘤样本进行了基因组和/或转录组范围的分子谱分析，其中包括23例总生存期（OS）>36个月的长期生存者、16例OS<12个月的短期生存者以及31例OS中等的患者。在本研究中，我们筛选了前瞻性招募的患者，这些患者具有胶质母细胞瘤的组织病理学参考诊断、诊断时已知的KPS评分、通过术后早期神经影像学获得的切除范围信息、初次手术时可供使用的冷冻组织标本以及有记录的临床结局。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。