原发性和遗传性嗜铬细胞瘤（PHEOs）与副神经节瘤（PGLs）的表达数据
该数据集来自 omicsdi.org，收录原发性和遗传性嗜铬细胞瘤（PHEOs）与副神经节瘤（PGLs）的表达数据。使用人类 HuGene1.0-ST 基因芯片评估基因型特异性表达谱差异，包含 7 例携带 HIF2A 或 PHD2 突变的 PHEO/PGL 患者样本
基本信息
资源简介
原发性和遗传性嗜铬细胞瘤（PHEOs）与副神经节瘤（PGLs）的表达数据
该数据集收录了原发性和遗传性嗜铬细胞瘤（PHEOs）与副神经节瘤（PGLs）的表达数据，来源于 omicsdi.org，归类于肿瘤／脑肿瘤方向，主题标签为转录组学。数据集使用人类 HuGene1.0-ST 基因芯片，对基因型特异性的表达谱差异进行了评估，共纳入 7 例携带 HIF2A 或 PHD2 突变的 PHEO/PGL 患者样本。样本取自病灶中心外观可存活的组织，经快速冷冻后用于 RNA 提取，每例样本均在切除后经病理学家检查，并进行了正常与肿瘤样本的微阵列分析。该数据集为研究遗传背景与表达谱之间的关系提供了转录组层面的资料。
【数据集背景】
嗜铬细胞瘤（PHEOs）和副神经节瘤（PGLs）是起源于神经嵴相关嗜铬组织的肿瘤，部分病例具有遗传背景。该数据集关注原发性和遗传性 PHEO/PGL，重点在于评估不同基因型之间的表达谱差异。所涉及的遗传学背景为 HIF2A 或 PHD2 突变，这两个基因与氧感知通路相关。数据集通过人类 HuGene1.0-ST 基因芯片对上述样本进行表达检测，以转录组学手段刻画不同基因型肿瘤的表达特征。数据集在来源站上被归类于肿瘤／脑肿瘤方向，主题标签为 Transcriptomics。
【数据内容】
数据集包含 7 例 PHEO/PGL 患者样本的表达数据，这些样本均携带 HIF2A 或 PHD2 突变。检测平台为人类 HuGene1.0-ST 基因芯片。源站描述指出，微阵列分析在正常样本和肿瘤样本上进行。样本取自病灶中心外观可存活的组织，经快速冷冻后用于 RNA 提取。每例 PHEO/PGL 样本在切除后均由病理学家进行检查。数据集的核心内容是基因型特异性表达谱差异的评估结果，属于转录组层面的表达数据。除上述信息外，源站未提供更细化的数据内容说明。
【采集与来源】
样本采集方面，取自病灶中心外观可存活的组织，并立即快速冷冻以用于后续 RNA 提取。每例 PHEO/PGL 样本在切除后均经过病理学家检查。表达检测使用人类 HuGene1.0-ST 基因芯片。数据集来源于 omicsdi.org。源站描述中提及对正常和肿瘤样本进行了微阵列分析。关于样本采集的具体时间、地点、机构、伦理审批信息以及患者人口学特征，源站未提供。
【适用场景】
该数据集适用于转录组学相关研究，尤其是围绕嗜铬细胞瘤和副神经节瘤中基因型特异性表达谱差异的分析。由于样本携带 HIF2A 或 PHD2 突变，可用于探讨这两类突变背景下肿瘤表达特征的研究。数据集包含正常与肿瘤样本的微阵列分析结果，可用于比较正常组织与肿瘤组织之间的表达差异。此外，该数据集也可作为遗传性 PHEO/PGL 表达谱研究的参考数据。关于更具体的适用场景，源站未提供。
【使用方法】
源站描述指出，表达谱差异的评估使用人类 HuGene1.0-ST 基因芯片完成，微阵列分析在正常和肿瘤样本上进行。数据集以表达数据形式提供。关于数据下载方式、文件格式、预处理流程、标准化方法、分析工具或代码等具体使用说明，源站未提供。
【质量与限制】
样本取自病灶中心外观可存活的组织，并经快速冷冻处理用于 RNA 提取，每例样本在切除后均经病理学家检查，这些环节有助于保证样本质量。数据集共包含 7 例携带 HIF2A 或 PHD2 突变的 PHEO/PGL 患者样本，样本量较小。关于数据集的批次效应、缺失值、质控指标、验证结果以及其它潜在限制，源站未提供。
【引用与许可】
关于该数据集的引用方式、许可协议、使用条款或数据访问限制，源站未提供。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://omicsdi.org/dataset/biostudies-arrayexpress/E-GEOD-50442
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
已使用人类HuGene1.0-ST基因芯片评估了基因型特异性的表达谱差异。在此数据集中，我们纳入了7例携带HIF2A或PHD2突变的PHEO/PGL患者样本的表达数据。从病灶中心采集看似存活的组织，并速冻以进行RNA提取。7例PHEO/PGL样本在切除后均经病理学家检查。对正常和肿瘤样本进行了微阵列分析。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
需要用于商业化训练或医疗器械注册（NMPA/FDA）？
公开数据往往缺乏完整的病理回证与专家标注。千方医数集依托三甲直采网络，提供合规、去标识化、支持注册级质控的专病数据集交易服务。
