Eval_GEMCODE DoubleMinuteBT WGS1 样本数据集
该数据集来自 omicsdi.org,属于肿瘤/脑肿瘤领域,主题标签为 Genomics。数据为全基因组测序文件,与论文《Structure and evolution of double minutes in diagnosis and relapse brain tumors》配套发布,覆盖脑肿

基本信息
资源简介
Eval_GEMCODE DoubleMinuteBT WGS1 样本数据集
Eval_GEMCODE DoubleMinuteBT WGS1 - samples 是一个面向肿瘤研究、特别是脑肿瘤方向的全基因组测序数据集,收录于 omicsdi.org。该数据集以 Genomics 为主题标签,属于肿瘤 / 脑肿瘤分类,其内容为全基因组测序文件,并与论文《Structure and evolution of double minutes in diagnosis and relapse brain tumors》配套发布。从整体定位来看,该数据集服务于对脑肿瘤中双微体(double minutes)结构与演化问题的研究,为相关分析提供测序层面的数据基础。由于数据名称中包含 samples 字样,可理解为其组织方式与样本相关,但具体样本数量、样本类型及测序平台等信息,源站未提供。
【数据集背景】
该数据集与一篇题为《Structure and evolution of double minutes in diagnosis and relapse brain tumors》的论文相伴发布。论文标题表明其研究关注脑肿瘤在诊断与复发过程中双微体的结构与演化。双微体是基因组中一类特殊的染色体外结构,常与基因扩增等现象相关,在肿瘤发生发展及复发机制研究中具有重要价值。该数据集作为论文的配套全基因组测序数据,旨在为上述研究提供原始或处理后的测序文件支持。关于论文的具体研究结论、实验设计细节以及双微体在脑肿瘤中的具体表现,源站未提供,需参阅原论文获取。
【数据内容】
该数据集的核心内容为全基因组测序文件,属于 Genomics 主题。数据名称中的 WGS 通常指全基因组测序(Whole Genome Sequencing),表明其数据类型为全基因组水平的测序数据。数据集名称中包含 DoubleMinuteBT,提示其与双微体及脑肿瘤(Brain Tumor)相关。数据以 samples 形式组织,可能对应多个样本的测序结果。然而,关于具体的文件格式、数据大小、样本数量、测序深度、覆盖度、是否包含原始读段或比对文件等信息,源站未提供。
【采集与来源】
该数据集来源于 omicsdi.org,属于肿瘤 / 脑肿瘤领域。其源站描述明确指出,这些全基因组测序文件是伴随论文《Structure and evolution of double minutes in diagnosis and relapse brain tumors》发布的,并建议读者阅读该论文以获取更多细节。关于样本采集的具体地点、时间、机构、伦理审批信息以及测序实验的具体操作流程,源站未提供。
【适用场景】
基于其主题标签与来源描述,该数据集适用于肿瘤基因组学、特别是脑肿瘤相关的研究场景。具体而言,可用于探索脑肿瘤诊断与复发过程中双微体的结构特征与演化规律,也可作为全基因组测序数据分析的输入,用于基因扩增、染色体外结构等方向的研究。此外,由于数据与特定论文配套,适合用于复现或验证该论文相关分析的研究工作。关于该数据集是否适用于其他特定分析流程或临床诊断用途,源站未提供。
【使用方法】
该数据集以全基因组测序文件形式提供,用户可根据自身研究需求下载并使用相关测序数据。由于数据与论文配套,建议在使用前阅读原论文,以了解样本背景、实验设计及数据分析方法。关于具体的下载方式、文件组织格式、是否需要特定软件处理、是否提供预处理流程或分析脚本等信息,源站未提供。
【质量与限制】
该数据集来源于 omicsdi.org,并与同行评议论文配套发布,这在一定程度上表明其数据经过相关研究的审核。然而,关于数据的具体质量指标,如测序深度、覆盖均匀性、碱基质量、样本污染情况等,源站未提供。此外,该数据集仅包含全基因组测序文件,不包含其他类型的组学数据。其适用范围可能受限于论文所研究的特定脑肿瘤类型与样本集。关于数据的局限性、偏差以及使用时的注意事项,源站未提供。
【引用与许可】
该数据集与论文《Structure and evolution of double minutes in diagnosis and relapse brain tumors》配套发布,使用时应引用该论文。关于数据的具体许可协议、使用条款、是否允许商业用途、是否需要联系原作者获取授权等信息,源站未提供。建议用户在使用前查阅 omicsdi.org 上该数据集的页面或原论文,以获取准确的引用与许可要求。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站:https://omicsdi.org/dataset/ega/EGAD00001004337
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
伴随论文《诊断和复发脑肿瘤中双微体的结构与演化》的全基因组测序文件。更多详情请阅读该论文。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
数据缺失?
依托陕西、四川两大基地,我们与超过十家三甲医院建立直接合作关系,覆盖合规授权、采集治理、专业标注、数据交付的全流程,为AI医疗团队提供即拿即用的高质量临床数据。
⚡️ 需要数据支持或标注服务?立即联系我们获取专业方案。




